Xpert MTB / RIF résultats chez les patients atteints de tuberculose précédente: pouvons-nous distinguer vrai de faux résultats positifs

Contexte Les patients ayant une tuberculose antérieure peuvent avoir un ADN résiduel dans les expectorations qui confond les tests d’amplification des acides nucléiques tels que Xpert MTB / RIF On sait peu de choses sur la fréquence des résultats «faux positifs» négatifs à la culture Xpert chez les patients en retraitement. Les méthodes de lavage automatisées par filtre de Xpert réduisent la fausse positivité en éliminant l’ADN résiduel associé aux cellules non intacte. Méthodes Les patients prétraités n = présentant des symptômes de tuberculose au Cap, en Afrique du Sud, ont subi une culture liquide à base d’expectorations. Comparaison des résultats de Xpert à partir de dilutions de bacilles intacts ou lysés à la chaleur et lysés mécaniquement. Les cas de retraitement étaient plus susceptibles d’être Xpert faux positifs / Xpert positifs étaient faux positifs que les nouveaux cas /% [% intervalle de confiance {CI},% -%] vs% [% CI,% -%]; P = Moins d’années depuis la fin du traitement ajusté odds ratio [aOR], [% CI, -], moins d’ADN mycobactérien aOR, [% CI, -] par cycle seuil [CT], et une radiographie thoracique ne suggérant pas de tuberculose active aOR, [% CI, -] ont été associés à une fausse positivité CT avait une précision sous-optimale pour une fausse positivité:% de Xpert-positifs avec CT & gt; serait faussement positif, bien que le% de faux positifs serait manqué aire de capacité prédictive CT sous la courbe, [% CI, -] n’a pas été améliorée par des variables supplémentaires Xpert détecté non viable, bacilles non intacts sans changement de CT vs controlsConclusions One in Xpert- Les patients ayant subi un retraitement positif étaient en culture négative et potentiellement faussement positifs. La fausse positivité était associée à une tuberculose antérieure récente, une TDM élevée et une radiographie thoracique ne suggérant pas une tuberculose active. Les cliniciens peuvent envisager d’attendre des tests de confirmation chez des patients en retraitement avec CT & gt; ; cependant, la plupart des faux positifs tombent au-dessous de ce point de coupe Xpert peut détecter l’ADN de bacilles non intacts et non intacts

tuberculose, diagnostic, Xpert, fausse positivité Xpert MTB / RIF Xpert; Cepheid est un test automatisé d’amplification de l’acide nucléique NAAT pour Mycobacterium tuberculosis et la résistance à la rifampicine , approuvé par l’Organisation mondiale de la Santé et la Food and Drug Administration des États-Unis. ] Xpert est utilisé couramment chez les patients qui ont déjà eu la tuberculose Ceci malgré les preuves qu’environ% des patients qui sont guéris microbiologiquement après des mois de traitement sont Xpert positifs , une corrélation prouvée entre le statut de retraitement et la spécificité diminuée L’ADN mycobactérien détectable, qui peut être extracellulaire ou associé à des cellules non-intacte et donc non cultivable, est une cause possible de cette fausse positivité, qui peut déclencher des injustices. traitement et exposer inutilement les patients à des médicaments toxiques, retarder l’établissement du bon Le fabricant recommande que Xpert soit toujours utilisé conjointement avec la culture , la capacité de culture n’est pas obligatoire pour l’utilisation de Xpert sur le terrain et même dans les pays à forte charge de morbidité tels que Afrique du Sud qui ont une capacité culturelle, la plupart des patients positifs Xpert ne reçoivent pas de culture, selon l’algorithme national Plus que les patients ayant des antécédents de tuberculose ont été diagnostiqués dans ; Cependant, il existe des données limitées sur la fréquence de la fausse positivité de Xpert chez les patients en retraitement et quels facteurs peuvent guider la pratique clinique Nous avons donc examiné la relation entre les résultats de Xpert et les informations quantitatives spécifiques au L’information clinique et la culture donnent lieu à une importante cohorte de patients testés pour la tuberculose dans le cadre du virus de l’immunodéficience humaine à forte prévalence du VIH au Cap, Afrique du Sud Interroger les allégations selon lesquelles Xpert ne détecte pas l’ADN libre en raison d’une étape de lavage préamplification , qui pourrait potentiellement réduire le risque d’un résultat de PF dans les cas de retraitement, nous avons effectué une étude de laboratoire afin de déterminer si Xpert peut détecter l’ADN des cellules non viables lysées

Méthodes

Recrutement des patients

Les patients ont été recrutés dans des cliniques de soins primaires ou des hôpitaux du Cap, en Afrique du Sud, dans le cadre d’études évaluant l’utilité de Xpert. Les patients inclus dans l’analyse finale étaient positifs pour Xpert et avaient un seuil de cycle. Les données tomodensitométriques étaient positives ou négatives pour la culture, avaient un statut antituberculeux antérieur connu, n’avaient pas été traitées pour & gt; heures, et n’avait pas pris de traitement antituberculeux quelques jours avant le test Cette étude a été approuvée par le comité d’éthique de la Faculté des sciences de la santé de l’Université du Cap

Tests de diagnostic

Deux échantillons d’expectorations appariés ont été recueillis au moment du recrutement. a été choisi au hasard pour un test Xpert, et l’autre a été utilisé pour une culture liquide Bectec, Dickinson et Co Si les patients étaient incapables d’expectorer les crachats, l’induction des expectorations avec une solution saline hypertonique a été réalisée. les données ont été recueillies dans un sous-ensemble de patients, tel que déterminé par le protocole parent

Expérience Xpert MTB / RIF Cell Lysis

Pour évaluer si Xpert a détecté des cellules non viables, mL de M tuberculosis HRv dans une solution saline tamponnée au phosphate et% Tween,, et des unités formant des colonies [CFU] mL- a été ajouté au rapport tampon Xpert: et après quelques minutes d’incubation intermittente secouant, ml a été ajouté à la cartouche Xpert directe Xpert En parallèle, une aliquote de -mL de chaque concentration a subi un traitement thermique ° C, heure, suivie d’une rupture mécanique en utilisant des tubes Lysing Matrix B mm billes de zirconium; Biochemicals de MP et un MP de préparation rapide Biochemicals mètres par seconde pour des intervalles de trois secondes avec des minutes reposant sur la glace entre les intervalles Après le battement de perle, le lysat a été laissé pour des minutes et ml de surnageant a été utilisé pour Xpert lysé Des aliquotes de μL de chaque dilution directe et lysée ont été étalées sur un supplément de gélose Middlebrook H avec un complexe d’acide oléique-albumine dextrose et incubées pendant des semaines à ° C pour vérifier la viabilité. Cette expérience a été réalisée en trois exemplaires.

Analyses statistiques

Xpert-positif, les patients positifs pour la culture ont été définis comme vrai positif TP et Xpert positif, les patients négatifs pour la culture ont été définis comme faux positifs FP Le test was a été utilisé pour comparer les proportions Le test de Mann-Whitney a été utilisé pour comparer les différences non paramétriques données continues Une régression logistique multivariable a été effectuée pour ajuster la confusion potentielle Une stratégie d’élimination rétrospective utilisant le test de ratio de vraisemblance a été utilisée pour finaliser chaque modèle Les analyses ont été effectuées en utilisant GraphPad Prism version Logiciel GraphPad et logiciel Stata version StataCorp Tous les tests statistiques sont -sided à α =

RÉSULTATS

Parmi les patients, nous avons exclu% patients qui n’avaient pas de résultat de culture positif ou négatif, étaient sous traitement & gt; Les patients restants avec un statut de culture connu,% étaient positifs pour la culture et% étaient positifs Xpert Un total de% patients étaient des cas de retraitement Un résumé de les caractéristiques démographiques et cliniques de la cohorte sont montrées selon le statut antituberculeux précédent dans le tableau. Les patients de retraitement étaient plus susceptibles d’être plus âgés et infectés par le VIH. Différences dans Xpert CT et années depuis l’achèvement du traitement antituberculeux précédent chez les patients nouveaux et en retraitement.

Tableau Caractéristiques démographiques et cliniques des patients inclus dans l’analyse qui présentaient des symptômes suggérant une tuberculose Caractéristique Aucune tuberculose antérieure n = TB antérieure n = P Valeur Caractéristiques démographiques Sexe féminin, non% / / Âge, y, médiane IQR – – & lt; Caractéristiques cliniques infectées par le VIH, Non% / / & lt; Score de morbidité TB, médiane IQR – – Caractéristiques du test Culture positive, Non% / / Temps de positivité, d, médiane IQR – – Xpert MTB / RIF-positif, Non% / / CT, médiane IQR – – CXR compatible avec tuberculose active, Non% / / Caractéristique Non Précédent TB n = Précédent TB n = P Valeur Caractéristiques démographiques Sexe féminin, Non% / / Âge, y, médiane IQR – – & lt; Caractéristiques cliniques infectées par le VIH, Non% / / & lt; Score de morbidité TB, médiane IQR – – Caractéristiques du test Culture positive, Non% / / Temps de positivité, d, médiane IQR – – Xpert MTB / RIF-positif, Non% / / CT, médiane IQR – – CXR compatible avec TB active, No% / / Abréviations: CT, seuil de cycle; CXR, radiographie thoracique; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; IQR, intervalle interquartile; Tuberculose, tuberculoseView Large

Figure Vue grandDownload slideBox-and-whisker complot comparant les valeurs Xpert MTB / RIF du seuil de cycle d’information quantitatif [CT] dans les échantillons Xpert positif positif, positif pour la culture et faux positif Xpert positif, négatif pour la culture pour le nouveau A ou patients de retraitement B, et une comparaison des années depuis l’achèvement du traitement antituberculeux antituberculeux chez les patients traités par Xpert positif selon l’état de la culture C Les valeurs médianes avec des intervalles interquartiles entre parenthèses sont montréesFigure View largeDownload slideBox-and-whisker comparaison de Xpert MTB / RIF seuil du cycle d’information quantitatif [CT] dans les échantillons Xpert-positifs, positifs pour la culture et faussement positifs Xpert-positifs et négatifs pour les nouveaux patients A ou les patients en retraitement B, et comparaison des années écoulées depuis l’achèvement du traitement antituberculeux antituberculeux antérieur chez les patients traités par Xpert-positive selon l’état de culture C Valeurs médianes avec intervalles interquartiles entre parenthèses a re montré

Xpert MTB / RIF fausse positivité chez les patients atteints de tuberculose nouvellement diagnostiquée

Xpert avait une sensibilité, une spécificité, une valeur prédictive positive PPV, et une valeur prédictive négative NPV de%% intervalle de confiance [IC],% -%,%% CI,% -%,%% CI,% -%, et%% CI ,% -%, respectivement, chez les nouveaux patients Quarante de% Xpert-positifs

Corrélats de la fausse positivité Xpert MTB / RIF

Les nouveaux cas de tuberculose avec un FP Xpert étaient, par rapport à ceux qui étaient TP, plus susceptibles d’avoir une médiane Xpert CT plus élevée [intervalle interquartile {IQR}, -] vs [IQR, -]; P & lt; et plus susceptibles d’être des femmes / [%] des cas de PF étaient des femmes vs / [%] des cas de TP; odds ratio [OR], [% CI, -] Dans un tableau d’analyse de régression logistique multivariée, chaque augmentation unitaire de CT était associée à une augmentation en% du risque relatif ajusté OR [aOR], [% CI, -] de Xpert false positivité, présumant que les autres variables restent constantes. Morbidité chez les patients présentant des symptômes de tuberculose score de score n = était similaire chez ceux avec une médiane de résultat FP ou TP Xpert, [IQR, -] vs [IQR, -]; P =

Facteurs de tableau associés à la fausse positivité de Xpert dans les nouveaux cas et les cas de retraitement Nouveaux patients tuberculeux n = analyse univariée Régression logistique multivariée Vrai positif Xpert n = faux positif Xpert n = OU% CI P Valeur ajustée OU% CI P Valeur Variables démographiques Age, y , médiane IQR – – – … … Femme, Non% / / – … … Fumeur, Non% / / – … … Variables cliniques Infection par le VIH, Non% / / – … … Information Xpert Valeurs CT spécifiques à la TB, IQR médian – – – & lt; – & lt; Retraitement Patients n = Vrai-Positif Xpert n = Faux-Positif Xpert n = OU% CI P Valeur Ajustée OU% CI P Valeur Variables démographiques Âge, y, médiane IQR – – – … … Féminin, Non% / / – … … Fumeur , Non% / / – … … Variables cliniques Infection par le VIH, Non% / / – … … Traitement antituberculeux antérieur non terminé, Non% / / – … … Années écoulées depuis l’arrêt ou l’achèvement du traitement antituberculeux antérieur, médiane IQR – – – – Xpert information Valeurs CT spécifiques à la TB, médiane IQR – – – & lt; – & lt; Nouveaux patients atteints de tuberculose n = analyse univariée Régression logistique multivariée Vrai positif Xpert n = faux-positif Xpert n = OR% CI P Valeur ajustée OR% CI P Valeur Variables démographiques Âge, y, médiane IQR – – – … … Féminin, No% / / – … … Fumeur, Non% / / – … … Variables cliniques Infection par le VIH, Non% / / – … … Informations Xpert Valeurs CT spécifiques à la TB, médiane IQR – – – & lt; – & lt; Retraitement Patients n = Vrai-Positif Xpert n = Faux-Positif Xpert n = OU% CI P Valeur Ajustée OU% CI P Valeur Variables démographiques Âge, y, médiane IQR – – – … … Féminin, Non% / / – … … Fumeur , Non% / / – … … Variables cliniques Infection par le VIH, Non% / / – … … Traitement antituberculeux antérieur non terminé, Non% / / – … … Années écoulées depuis l’arrêt ou l’achèvement du traitement antituberculeux antérieur, médiane IQR – – – – Xpert information Valeurs CT spécifiques à la TB, médiane IQR – – – & lt; – & lt; Les versions de ce tableau pour tous les patients Tableau supplémentaire ou restreint au sous-groupe de patients avec des données radiographiques thoraciques Tableau supplémentaire sont fournis dans les données supplémentaires. Abréviations: IC, intervalle de confiance; CT, seuil de cycle; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; IQR, intervalle interquartile; OU, odds ratio; TB, tuberculose View LargeWhere CXR données n = étaient disponibles, les patients FP étaient moins susceptibles d’avoir un CXR compatible avec la tuberculose active que les patients TP / [%] vs / [%]; P = et, lorsque inclus dans un modèle de régression logistique multivariable avec une tuberculose et une TDM antérieures, un CXR compatible avec la tuberculose active était associé à un% de réduction de la probabilité relative de fausse positivité de Xpert aOR, [% CI, -]; Tableau supplémentaire

Analyses de courbe caractéristique de fonctionnement du récepteur

L’aire sous la courbe AUC pour CT [% CI, -] n’augmente pas lorsque CXR [% CI, -] est inclus Figure Courbes caractéristiques de fonctionnement du récepteur [ROC] pour CT uniquement, et non ceux qui ont aussi des données CXR dans la figure supplémentaire À un point de coupe hors de la règle CT & gt; pour Xpert, une fausse positivité est sélectionnée en fonction du% de sensibilité; c.-à-d.% de FP Xperts est tombé au-dessus de ce seuil, CT seul avait une spécificité, VAN et rapport de vraisemblance négatif LR de%,%, et, respectivement, Tableau à point de coupe sélectionné basé sur% spécificité de & gt ;, CT avait une sensibilité, PPV, et LR positif de%,% et, respectivement A un point de coupure CT & gt; correspondant à l’indice de Youden, CT avait une sensibilité, spécificité, NPV, PPV, LR positif, et LR négatif de%,%,%,%, et, respectivement

Précision du tableau des valeurs de seuil de cycle pour prédire la fausse positivité Xpert MTB / RIF chez les nouveaux patients et les patients en retrait Utilisation de test suggérée Sensibilité au point de CTC suggérée,%% CI Spécificité,%% CI PPV,%% CI NPV,%% CI Positif LR% CI Négatif LR% CI Nouveaux patients n = Règle d’entrée & gt; – – – – – – Exclusion & gt; – – – – – – Youden indexa & gt; – – – – – – Patients de retraitement n = Règle d’entrée & gt; – – – – – – Exclusion & gt; – – – – – – Youden indexa & gt; – – – – – – Test d’utilisation Sensibilité au point de coupure suggérée,%% CI Spécificité,%% CI PPV,%% IC NPV,%% CI Positif LR% CI Négatif LR% CI Nouveaux patients n = Règle d’entrée & gt; – – – – – – Exclusion & gt; – – – – – – Youden indexa & gt; – – – – – – Patients de retraitement n = Règle d’entrée & gt; – – – – – – Exclusion & gt; – – – – – – Youden indexa & gt; – – – – – – Abréviations: IC, intervalle de confiance; CT, seuil de cycle; LR, rapport de vraisemblance; NPV, valeur prédictive négative; PPV, valeur prédictive positive Défini comme le meilleur compromis entre sensibilité et spécificité en supposant une pondération égale View Large

Figure Vue grandDownload slideReceiver courbes de fonctionnement des valeurs de seuil Xpert MTB / RIF cycle et des informations cliniques pour la prédiction de Xpert MTB / RIF fausse positivité chez les nouveaux patients A ou de retraitement B et C Abréviations: AUC, aire sous la courbe; CI, intervalle de confiance; CT, seuil de cycle; CXR, radiographie thoracique; TB, tuberculoseFigure View largeTélécharger Diagramme des courbes de fonctionnement du récepteur Xpert MTB / RIF valeurs de seuil de cycle et des informations cliniques pour la prédiction de Xpert MTB / RIF fausse positivité chez les nouveaux patients A ou de retraitement B et C Abréviations: AUC, aire sous la courbe; CI, intervalle de confiance; CT, seuil de cycle; CXR, radiographie thoracique; TB, tuberculose

Figure View largeTélécharger la lameComparaison des valeurs seuils de cycle Xpert MTB / RIF ± SEM d’une série de bacilles de dilution, montrant CT similaire lorsque Xpert MTB / RIF a été réalisée sur des bacilles intacts ou non viables, bacilles lysés thermiquement et mécaniquement Trois réplicats expérimentaux ont été réalisés Abréviations: ANOVA, analyse de variance; CFU, unités formant des colonies; CT, seuil de cycle; Comparaison des valeurs de seuil du cycle MTB / RIF Xpert moyenne ± SEM d’une série de dilution de bacilles, montrant CT similaire lorsque Xpert MTB / RIF a été réalisée sur des bacilles intacts ou non viables, lysé thermiquement et mécaniquement bacilli Trois réplicats expérimentaux ont été réalisés Abréviations: ANOVA, analyse de la variance; CFU, unités formant des colonies; CT, seuil de cycle; SEM, erreur standard de la moyenne

Xpert MTB / RIF Faux Positivité Chez Les Patients De La Tuberculose En Retraite

Xpert avait une sensibilité, une spécificité, une VPP et une VAN de% IC%,% -%,%% CI,% -%,%% CI,% -% et%% CI,% -% chez les patients en retraitement Quarante-cinq de% Xpert-résultats positifs étaient faux positifs P = par rapport aux nouveaux cas

Corrélats de la fausse positivité Xpert MTB / RIF

Bien que les patients en retraitement avec un FP Xpert étaient plus âgés que ceux avec un TP Xpert dans une analyse univariée Median [IQR], {-} vs {-} ans; P =, après des ajustements multivariés, seulement CT aOR, [% CI, -]; P & lt; et le nombre d’années écoulées depuis l’arrêt du traitement pour l’épisode précédent de tuberculose aOR, [% IC, -]; P = étaient des prédicteurs indépendants du tableau Xpert FP Il n’y avait pas de corrélation entre la TDM et les années depuis l’arrêt du traitement pour la tuberculose antérieure P =; Figure supplémentaire Lorsque les données radiographiques étaient disponibles, un CXR compatible avec la tuberculose active était également un prédicteur indépendant de la fausse positivité de Xpert aOR, [% CI, -]; Tableau supplémentaire

Analyses de courbe caractéristique de fonctionnement du récepteur

Courbe ROC Les AUC de% CI, -,% CI, -,% CI, -, et% CI, – ont été obtenues pour CT seul, un modèle intégrant CT et le nombre d’années depuis l’arrêt du traitement, un modèle intégrant CT et CXR, et un modèle incorporant toutes les variables, respectivement la figure CT avait, à un point de coupure pour exclure la fausse positivité Xpert sélectionnée sur la base du% de sensibilité; c.-à-d.,% des Xperts FP chez les patients de retraitement sont tombés au-dessus de ce seuil, une spécificité, NPV, et LR négatif de%,%, et, respectivement, point de coupe & gt ;, alors qu’en règle générale sur le% de spécificité, il avait une sensibilité, PPV, et LR positif de%,%, et, respectivement, point de coupure & gt; Table à un point de coupe & gt; correspondant à l’indice de Youden, CT avait une sensibilité, spécificité, NPV, PPV, LR positif, et LR négatif de%,%,%,%, et, respectivement

Détection de l’ADN de bacilles non viables

Chaque dilution de bacilles, et de UFC mL- a été détectée comme positive lorsque Xpert a été faite directement ou sur lysat. Des TC similaires ont été obtenus directement vs lysé: vs; P =, vs; P =, et vs; Les dilutions mL de CFU n’ont pas été détectées Après des semaines d’incubation, chaque aliquote utilisée pour Xpert direct a augmenté le nombre attendu de CFU, alors qu’aucune croissance n’a été observée à partir des aliquotes de chaleur inactivée. , bacilles aux perles

DISCUSSION

CT pour différencier mal entre les résultats de TP ou de FP Xpert Par exemple, à un point de coupure de suppression d’exclusion optimisé CT & gt; ; % de sensibilité chez les patients en retraitement, seulement un tiers des patients vrais-positifs seraient correctement classés, et seulement dans les résultats FP Xpert seraient correctement classés Inversement,% des cas de FP seraient manqués à un point de coupure éliminatoire optimisé CT & gt; ; La spécificité de%, et moins de la moitié des résultats Xpert-positifs avec CT au-dessus de ce seuil serait correctement classé comme FP Bien que sous-optimal pour une utilisation en routine clinique, ce résultat suggère que les cliniciens devraient être prudents dans l’interprétation des résultats Xpert-positifs dans patients de retraitement avec CT & gt; et qu’ils souhaiteraient attendre les résultats des tests de confirmation de culture avant de commencer le traitement Cette étude, ainsi que d’autres qui ont démontré que la tomodensitométrie est un indicateur utile de la charge bactérienne et de l’infectiosité , suggère que les laboratoires Cette étude est la première à décrire une association inverse entre les résultats de Xpert FP et le temps écoulé depuis l’arrêt du traitement antérieur, et l’utilité de CXR pour différencier Xpert TP des patients FP Bien que ces outils réduisent la probabilité d’un résultat FP Malheureusement, ils n’ont pas amélioré la capacité discriminatoire relativement faible de la TDM car plusieurs patients TP ont récemment été traités pour une tuberculose active, ce qui reflète notre taux de transmission élevé, ou un RCX ne suggérant pas une tuberculose active comme le fait Xpert. ne détecte pas l’ADN des mycobactéries non tuberculeuses , presque tous les résultats positifs reflètent probablement la détection réelle de M tuberculosis ADN complexe ; cependant, cela ne correspond pas toujours à la présence d’une maladie active causée par des bacilles intacts et viables. Nos recherches démontrent que le système de traitement des échantillons embarqués de Xpert est incapable d’éliminer l’ADN génomique des cellules non intactées qui peuvent être présentes dans le retraitement. Ceci est probablement le mécanisme par lequel Xpert FP se produit, et suggère que le mécanisme automatisé de Xpert pour isoler les bacilles intacts avant l’extraction de l’ADN nécessite une optimisation si la fausse positivité due à la détection d’ADN extracellulaire ou d’ADN dans les cellules non intactes doit être minimisée. , une étude a observé Xpert pour éliminer efficacement un grand nombre d’amplicons dans les expectorations dopées, empêchant la détection ; Cependant, contrairement à notre étude, ce travail antérieur utilisait de l’ADN libre de faible poids moléculaire. Notre étude a des limites Les autres causes de fausse positivité Xpert incluent les variations de la qualité des échantillons et de la charge bactérienne dans les différents échantillons utilisés pour Xpert et culture et les limites stochastiques de ces tests, qui peuvent provoquer des résultats de référence faux négatifs et donc des résultats Xpert faussement positifs, qui peuvent être minimisés par des cultures répétées. La culture elle-même est un étalon imparfait avec une sensibilité incomplète, bien qu’elle soit largement utilisée dans la pratique clinique et la recherche. Plusieurs facteurs peuvent étayer cette sensibilité incomplète, notamment l’erreur d’échantillonnage, la réactivité immunitaire différentielle dans les cas de retraitement et des raisons techniques, entre autres. En outre, nous manquons de données cliniques systématiques à long terme à incorporer dans une norme de référence; cependant, ceci manque de spécificité car le surtraitement empirique est fréquent dans les contextes à forte charge [,,], les patients sans tuberculose peuvent encore améliorer lorsqu’ils sont sous traitement antituberculeux, et les patients avec tuberculose et une infection concomitante, par exemple, Pneumocystis peuvent toujours échouer. les échantillons de contamination croisée sont, comme toujours, des sources potentielles d’erreur; Cependant, Xpert est un système fermé qui génère peu d’aérosols , et nous avons effectué Xpert dans un laboratoire de qualité garantie, séparé de celui utilisé pour la culture. Enfin, il convient également de noter que ces résultats proviennent d’un environnement fortement chargé. une tuberculose de retraitement est relativement fréquente et devrait faire l’objet d’une validation plus poussée, notamment dans différents contextes. En résumé, les patients ayant des antécédents de tuberculose, une tuberculose antérieure plus récente et un RXC incompatible avec une tuberculose active présentent un risque plus élevé d’Xpert. fausse positivité; cependant, ceux-ci n’ajoutent pas de pouvoir discriminatoire au-delà de la TDM seule. Bien que la plupart des cas de FP seraient manqués, les cliniciens devraient traiter CT & gt; Une étude plus poussée est nécessaire pour différencier les patients TAAT des patients TP, y compris la recherche de technologies excluant l’ADN des cellules non-intactées telles que le monoazide de propidium ou la coloration au monoazide d’éthidium ou détecter l’ARN messager dans les bacilles vivants. important que les TAAN de prochaine génération, comme Xpert Ultra, auront une sensibilité proche de celle de la culture , et donc plus susceptibles de détecter de faibles quantités d’ADN tuberculeux résiduel et ont une faible spécificité chez les patients qui ont déjà eu la tuberculose

Remarques

Remerciements Les auteurs sont redevables aux patients qui ont participé à cette étude. Nous remercions Marietjie Pretorius, Ruth Wilson et Raylene Titus pour leur aide financière. Ce travail a été soutenu par une bourse de formation Wellcome Trust en santé publique et médecine tropicale GT, / Z // Z , et le Prix de Développement de Carrière du Conseil de Recherche Médicale d’Afrique du Sud au GT et un Prix du Centre de Collaboration aux contributions de K DAuthor Conception et conception: GT et KD Collecte de données: tous les auteurs Analyse et première ébauche: Interprétation GT et KD: Auteurs Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit rapporté Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués