Utilisation du nombre variable de répétitions en tandem de génotypes multiples Analyse du génotypage pour déterminer le rôle des transporteurs asymptomatiques dans la transmission de Clostridium difficile

Contexte Des études antérieures ont suggéré que les porteurs asymptomatiques de Clostridium difficile toxigène sont une source d’infections nosocomiales à l’hôpital. Multilocus variable nombre d’analyses de répétitions en tandem MLVA est un outil de sous-typage moléculaire hautement discriminatoire qui aide à déterminer les sources de transmission possibles. Des prélèvements d’entérocoques résistants à la vancomycine et des échantillons cliniques de selles toxiques à C difficile de juillet à novembre ont été effectués à l’UPMC MLVA presbytérienne de l’Université de Pittsburgh afin de déterminer les relations génétiques entre les isolats de porteurs asymptomatiques et les patients Infection à HA Cdi HA-CDI Les isolats asymptomatiques et les isolats HA-CDI ont été considérés comme associés si l’isolat de transport a été prélevé avant l’isolat HA-CDI et si les génotypes MLVA présentaient une différence de répétition en tandem de ≤Résultats de patie Les cas incidents de CDI classés comme HA à l’UPMC au cours de l’étude avec les isolats disponibles,% de cas ont été associés à des patients CDI, alors que% des cas ont été associés à des CDI toxinogènes alcalose. Dans notre hôpital avec un programme établi de contrôle des infections conçu pour contenir la transmission des patients CDI symptomatiques, les porteurs asymptomatiques semblent avoir joué un rôle important dans la prévention des infections. transmission L’identification et l’isolement des porteurs peuvent être nécessaires pour réduire davantage la transmission du C difficile dans de tels milieux

Clostridium difficile, dépistage, transmission, génotypage, MLVVoir le commentaire éditorial de McDonald sur les pages -Des études précédentes ont établi que les porteurs asymptomatiques de Clostridium difficile sont plus nombreux que les patients symptomatiques dans les services médicaux Shim et al ont trouvé que les porteurs CDI Dans une étude, le C difficile provenant des porteurs est apparu par la suite dans les ICD HA liées à l’hôpital, attribuables à la même souche chez 100% des patients Surveillance active Des tests d’identification du Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline et des porteurs d’entérocoques résistants à la vancomycine couplés à des mesures d’isolement ont permis de réduire les infections par ces organismes Une approche similaire de la prévention des ICD n’a pas été possible avant le développement récent des tests moléculaires qui permettent la détection de l’état de porteur de C difficile avec une raison Bien que les précédentes études de la transmission CDI basée sur l’analyse des endonucléases de restriction REA comme l’approche épidémiologique moléculaire primaire ont montré que les transporteurs asymptomatiques ont un rôle dans la transmission CDI, les directives actuelles de contrôle des infections se concentrent sur les mesures d’isolement pour les patients CDI symptomatiques. Le MLVA pour le typage C difficile a plus de pouvoir discriminatoire que REA et facilite ainsi le suivi de la transmission du C difficile dans les hôpitaux Nous avons effectué le génotypage MLVA des isolats de C difficile chez des patients colonisés et infectés afin d’évaluer le potentiel de chacun. HA-CDI et de déterminer le rôle potentiel de la surveillance active pour le transport de C difficile dans un hôpital avec un programme établi de contrôle des infections qui a été associé à un contrôle efficace de l’IDC-HA

Méthodes

Population de patients et contexte

Cette étude a été menée à l’Université de Pittsburgh Medical Center Presbyterian-Shadyside UPMC, un hôpital d’enseignement des lits unité de soins intensifs affiliés à l’Université de Pittsburgh Patients subissant des tests de surveillance ERV sur une période de Juillet à Novembre ont également été dépistage des cultures de surveillance de l’ERV en C. difficile ont été effectuées à l’admission pour les patients admis d’autres établissements de soins de santé; La surveillance des ERV a également été effectuée à des intervalles hebdomadaires pour tous les patients des soins intensifs et pour tous les autres patients hospitalisés ayant une durée de séjour & gt; jours & gt; Les patients identifiés comme étant positifs aux ERV ont été placés en isolement de contact pour les soins de santé actuels et subséquents et n’ont pas été réévalués. Les interventions de réduction du Clostridium difficile n’ont pas changé au cours de l’étude, y compris l’isolement par contact pendant la durée de l’hospitalisation pour les patients identifiés comme colonisés ou infectés par le test de toxicité des selles de C difficile Depuis, le taux de CDI-HA à l’UPMC n’a jamais dépassé notre taux cible par patient-jour. En plus des mesures précédemment rapportées, ppm d’hypochlorite de sodium était couramment utilisé pour désinfecter toutes les zones de soins des patients. Cette étude a été approuvée par le Conseil d’examen institutionnel de l’Université de Pittsburgh.

Diagnostic et dépistage du Clostridium difficile

Diagnostic en laboratoire de cytotoxicité des toxines de selles commandées par des médecins Diagnostic Hybrids, Athens, Ohio, de spécimens de selles formées et non formées Les deux écouvillons périrectaux recueillis pour les tests de dépistage de la VRE et les toxines fécales positives ont été cultivés pour le C difficile à l’aide de bouillon enrichissement et culture anaérobie Des échantillons positifs de toxines fécales ont été cultivés pour C difficile ± jours par rapport à la période étudiée. Toxigène C difficile a été confirmé par génotypage tcdC pour les toxines fécales et les tests de dépistage Le C difficile a été calculé comme le nombre de tests de dépistage positifs pour le C difficile toxigène divisé par le nombre total de tests de dépistage recueillis chez les patients ayant des toxines fécales positives entre les jours précédant le prélèvement de la toxine fécale. cliniciens

Typage moléculaire du C difficile

Les génotypes tcdC de cette étude ont été assignés selon la base de données PubMLST http: // pubmlstorg / cdifficile et ont été utilisés pour inférer ribotype comme décrit par Dingle et al Allele désignations pour tcdC conforme à ceux précédemment décrits à l’exception des génotypes, A et B, qui ont été renumérotés comme,, et respectivement L’analyse de l’arbre minimum couvrant tous les isolats récupérés dans l’étude a été réalisée en utilisant la version du logiciel BioNumerics Maths, Austin, Texas, en utilisant un coefficient de Manhattan pour calculer la différence de tandem-répétition sommée STRD entre isolats Les complexes contenant ≥ isolats dont les génotypes MLVA ont généré un STRD de ≤ ont été définis comme des isolats hautement apparentés

Définitions épidémiologiques et analyse

Les patients avec des toxines selles positives collectées à l’UPMC pendant la période d’étude plus un délai de plusieurs jours pour tenir compte de la période d’incubation potentielle des CDI ont été classés épidémiologiquement par le contrôle de l’infection UPMC selon des critères modifiés pour la surveillance CDI. Les CDI survenant dans les mois précédant l’admission à l’UPMC ou présents en réadmission avec une exposition documentée à l’UPMC sans exposition à d’autres établissements de santé au cours des semaines précédentes ont été classées comme des CDI récurrentes avec des toxines fécales positives mais Les patients ayant subi un test de dépistage du C difficile ont subi un examen des dossiers électroniques des toxines fécales au cours de la période d’étude ± semaines, et les patients sans toxines fécales ont été définis comme porteurs et ont été catégorisés en groupes: carrie persistante rs: patients avec au moins des tests de dépistage positifs pour le C difficile toxigène collectés à ≥ jours d’intervalle et sans toxines de selles ordonnées par les cliniciens; porteurs transitoires: patients avec seulement un test de dépistage positif pour C difficile toxigène ou & gt; test recueilli au cours d’une journée, et tests de dépistage négatifs collectés avant et après; et porteurs indéterminés: patients avec des cultures de dépistage uniques ou & gt; Les patients ayant reçu ≥ toxine fécale négative au cours de l’étude ± semaines ont été définis comme des porteurs discordants. Une revue des dossiers pour exclure les antécédents d’ICD diagnostiqués dans des établissements non UPMC a été réalisée pour les transporteurs liés à incident HA-CDI par le logiciel MLVATheraDoc Hospira, Salt Lake City, Utah a été utilisé pour déterminer les emplacements des patients avec tous les patients avec des isolats fortement liés par MLVA à HA-CDI Ces données ont été utilisées pour classer chaque cas HA-CDI dans la voie de transmission la plus probable : transmission en salle: les patients partageaient une hospitalisation commune avec un patient ou un porteur symptomatique d’ICD en quelques jours; transmission hors salle: patient hospitalisé en même temps qu’un patient porteur ou CDI en quelques jours sans unité commune; environnement: patient développé CDI après placement dans une pièce précédemment occupée par un porteur ou un patient CDI; ou indéterminé: patients sans lien épidémiologique temporel avec des patients avec des isolats très apparentés Pour chaque patient, la date de collecte de l’isolat source présumé doit précéder celle de la date de début des symptômes du C difficile d’au moins le jour civil

Cultures environnementales

Afin de déterminer si les porteurs étaient contaminés par C difficile, des cultures environnementales ont été réalisées pour tous les patients répondant aux critères suivants: test de dépistage du C difficile toxinogène; pas en contact avec les précautions d’isolement; et patients hospitalisés au moment de la confirmation de la culture Cinq sites dans chaque chambre ont été cultivés avec amplification sélective du bouillon à l’aide de compresses de gaze stériles pré-humidifiées avec du sérum physiologique tamponné aux phosphates. , siège de toilette et clavier d’ordinateur Pour les salles non-USI, les emplacements étaient les mêmes, sauf que le clavier téléphonique du patient a été remplacé par le clavier de l’ordinateur.

RÉSULTATS

Incident HA-CDI

Au cours de la période de dépistage, les patients ont eu des tests de toxicité des selles positifs pour le C difficile, dont% ont été classés comme porteurs des patients symptomatiques restants,%, ont été classés comme HA-CDI à l’UPMC,% comme acquis communautaire, et% Acquis à d’autres installations ou rechutes de cas de HA-CDI pendant la période de dépistage plus la période de latence, des isolats ont été obtenus à partir de% cas. Parmi ces cas, MLVA n’a rapporté aucun cas à aucun isolat récupéré pendant l’étude. complexe d’isolats hautement apparentés; Ces derniers ont été récupérés aussi tard que le jour de l’étude. Des analyses moléculaires combinées avec l’analyse épidémiologique du temps ont été effectuées pour les cas de% HA-CDI Tableau Les porteurs identifiés par les tests de dépistage seulement ont été identifiés comme sources pour un total de dans la période d’étude; de ceux-ci, ont été classés comme transmissions hors salle, transmissions de quartier, transmissions environnementales et indéterminées. La source présumée de cas de HA-CDI classée comme une transmission non-porteuse était un patient qui a été diagnostiqué plus tard avec CDI; les tests de dépistage du patient source étaient des jours positifs avant la collecte du premier test de toxine fécale, et le patient n’était pas en contact au moment de la transmission présumée Quatre des porteurs identifiés comme source étaient déjà en contact avec des infections Tableau Aucun autre cas de HA-CDI n’a pu être imputé à une source qui a été déterminée comme étant colonisée par des tests de toxicité des selles. % cas; de ceux-ci, ont été classifiés comme transmissions non-ward, comme transmissions de CDI de ward, et comme transmissions environnementales Table Les événements de transmission de ward se sont produits dans différentes unités

Cultures de criblage

Au cours de la période d’étude,% de tests de dépistage effectués sur les patients étaient positifs pour C difficile toxigène Des patients dépistés,% et% étaient positifs pour C difficile toxigène et ERV sur au moins spécimen, respectivement Parmi les patients,%,%,%,% ,% et% patients avaient un total de,,,,, et & gt; Des tests de dépistage ont été effectués, respectivement. Chez les patients positifs au C difficile toxigène, les patients étaient également positifs au VRE au moins une fois alors que les patients ne présentaient aucun test ERV positif. Le dépistage positif des ERV pendant l’étude était associé à un risque accru de C sur au moins l’odds ratio d’échantillon [OR],; % d’intervalle de confiance [IC], – Parmi les patients positifs pour le C difficile et l’ERV, le C difficile a été identifié en premier chez% des patients, le même jour chez% des patients et ensuite chez% des patients. Des isolats de C difficile ont été obtenus à partir des toxines de selles positives et / ou des cultures de dépistage de patients. De ces patients, de% ont été détectés en utilisant des cultures de criblage seulement de ces patients, de%, de%, de% et de%. longueur, les transporteurs discordants, persistants, et transitoires, respectivement Au cours de la période de dépistage, de% admissions ont été testés pour ERV

Cultures environnementales

Cinq des patients qui répondaient aux critères de culture environnementale avaient récupéré du C difficile au moins sur le site. Le patient sans récupération de C difficile était classé comme un transporteur transitoire et avait été déplacé dans une autre pièce à la date du prélèvement. Tous les patients les sites de chambre positifs pour C difficile avaient des isolats fortement apparentés à la MLVA pour isoler des cultures de criblage ou plus. Tableau En outre, les isolats environnementaux provenant de patients n’étaient pas apparentés STRD & gt; L’un des sites les plus souvent contaminés était la cloche d’appel du patient.

Tableau Clostridium difficile récupéré à partir de cultures environnementales de patients asymptomatiques Patient Source / site Intervalle de culture, d tcdC Génotype MLVA Locus CDR MLVA Cluster Classification épidémiologique STRD Culture de criblage NA u Porteur persistant Cloche d’appel # w Cloche d’appel environnemental # Environnement Clavier d’ordinateur # culture u Culture persistante Culture de criblage NA x Culture de criblage déconcertante x Culture de criblage déconcertante x Table de chevet déconcertante x Siège de toilette écologique Aucune Environnement Criblage Culture NA C Transporteur persistant Culture de criblage C Porteur persistant Cloche d’appel C Environnement Criblage culture NA Aucun Porteur persistant Cloche d’appel V Environnement Criblage Culture V Porteur persistant Culture de criblage NA N Déclarante Culture de criblage N Déconseillée Culture de criblage N Barrière de lit discrète N Table de nuit environnementale N Téléphone écologique N Abattant de toilettes Environnement N Culture de criblage N Patient discordant Source / Site Intervalle de culture , d tcdC Génotype MLVA Locus CDR MLVA Cluster Classification épidémiologique STRD Culture de criblage NA u Porteur persistant Cloche d’appel # w Cloche d’appel environnemental # u Environnement Clavier d’ordinateur # w Environnement Screening culture u Porteur persistant Criblage cultur Culture de dépistage déconcertante x Table de chevet déconcertante x Siège de toilette écologique Aucune Environnement Criblage Culture NA C Transporteur persistant Culture de criblage C Porteur persistant Cloche d’appel C Environnement Criblage Culture NA Porteur persistant Cloche d’appel V Environnement Criblage culture V Porteur persistant Culture de dépistage NA N Discipline Culture de dépistage N Culture de dépistage discordante N Lit de lit discret N Table de nuit environnementale N Téléphone écologique N Siège de toilette environnemental N Environnement Culture de dépistage Tous les patients étaient encore dans la pièce ou échantillonnés avant la désinfection terminale Tous les isolats de Clostridium difficile provenant de l’environnement des patients et des cultures de dépistage sont inclus Siège de toilettes, cloche d’appel, téléphone, barrière et table de chevet lits d’unité de soins] ont été échantillonnés par patient. Le patient a fait l’objet d’un échantillonnage dans des chambres de soins intensifs, le patient venant d’être transféré. minutes avant l’échantillonnage L’intervalle est le nombre de jours entre la première culture de dépistage du patient et toute culture subséquente. Les complexes MLVA se conforment à la figure et au tableau supplémentaire. Le STRD répertorié pour chaque isolat est le STRD entre la première culture de dépistage du patient et l’isolat répertorié. à celles décrites pour les porteurs de C difficile dans la section Méthodes Abréviations: MLVA, nombre variable multilocus d’analyses de répétitions en tandem; NA, non applicable; STRD, résumé de la distance tandem-repeatView Large

Tableau Analyse épidémiologique des patients atteints d’infections à Clostridium difficile classées à l’hôpital de Pittsburgh Medical Center, juillet-novembre Journée d’étude MLVA Complex tcdC Génotype Même unité Séjour à l’hôpital simultané au même lit Dates d’exposition à Sourcea Classification de la présumée Sourceb Nombre de jours Entre la source et la culture patiente Classification de la catégorie de transmission la plus probable STRD Source au cas F Non Non Oui – à – Non CDI K Oui Non Oui – à – – Quartier CDI F Oui Oui Oui – à – – Environnement A Oui Non Oui – à – Quartier CDI M Non Non Oui – à – Non CDI C Oui Non Oui – à – Transporteur de quartier F Non Non Oui – à – – Transporteur non résident c M Oui Non Oui – à – – Quartier CDI S Oui Oui Oui – à – – Environnement M Oui Non Oui – à – – Quartier CDI W Non Non Oui – à – d – Carrière non assistée M Oui Non Oui – à – – Transporteur de quartier C Non Non Oui – à – CDI hors salle Q Non Non Oui – à – – Carrière non V Non Non Oui – à – – Transporteur hors service c U Non Non Non Inconnu – Indéterminé N Oui Oui Non – à – Environnemental C Non Non Oui – à – Transporteur non résidant c B Non Non Oui – à – – Non-ward carriere c J Non Non Oui – à – – Non-ward carriere J Non Non Oui – à – – Transporteur non-M M Non Non Oui – à – – Carrière non-M M Oui Non Oui – à – – Quartier CDI H Non Non Non Inconnu – Indéterminé J Non Non Oui – à – Transporteur non-résident J Non Non Oui – à – IDC non lié G Oui Non Oui – à – CDI de quartier H Oui Non Oui – à – – Quartier CDI J Non Non Oui – à – Non CDI J Non Non Oui – à – Non CDI J Non Non Oui – à – Non CDI D Oui Oui Oui – à – Environnement H Non Non Oui – à – – Journée d’étude CDI hors salle Complexe MLVA tcdC Génotype Même unité Séjour à l’hôpital simultané au même lit Dates d’exposition à Sourcea Classification de la source présuméeb Nombre de jours entre la source et la culture patiente Classification de la catégorie de transmission la plus probable Source STRD au cas F Non Non Oui – à – Non CDI K Oui Non Oui – à – – Quartier CDI F Oui Oui Oui – à – – Environnement A Oui Non Oui – à – Quartier CDI M Non Non Oui – à – Non CDI C Oui Non Oui – au transporteur de quartier F Non Non Oui – à – – Transporteur non titulaire c M Oui Non Oui – à – – Quartier CDI S Oui Oui Oui – à – – Environnement M Oui Non Oui – à – – Quartier CDI W Non Non Oui – à – d – Carrier non-gardien M Oui Non Oui – à – – Porteur C Non Non Oui – à – CDI non-Q Q Non Non Oui – à – – Non-ward carriere V Non Non Oui – à – – Transporteur hors service c U Non Non Non Inconnu – Indéterminé N Oui Oui Non – à – Environnement C Non Oui – à – Non-ward carrier c B Non Non Oui – à – – Non-ward carriere J Non Non Oui – à – – Non-ward carriere J Non Non Oui – à – – Non-ward carrier M Non Non Oui – à – – Carrière non assistée M Oui Non Oui – à – – Quartier CDI H Non Non Non Inconnu – Indéterminé J Non Non Oui – à – Non-ward carrier J Non Non Oui – à – CDI non-G Oui Non Oui – à – CDI H Oui Non Oui – à – – Quartier CDI J Non Non Oui – à – Non CDI J Non Non Oui – à – Non- CDI J Non Non Oui – à – CDI non fréquent D Oui Oui Oui – à – Environnemental H Non Non Oui – à – – IDC hors du quartier Patient pour lequel un isolat n’était pas disponible pour le génotypage n = et avec Clostridium difficile ayant Les désignations de grappes MLVA sont conformes à celles de la figure et du tableau supplémentaire, tandis que la classification des sources et la catégorie de transmission présumée sont conformes aux définitions présentées dans la section Méthodes Abréviations : CDI, infection à Clostridium difficile; MLVA, nombre variable multilocus d’analyses de répétitions en tandem; STRD, résumé tandem-repeat differencea Relatif au test de toxine du patient dateb = transporteur discordant; = Infection à C difficile acquise à l’Université de Pittsburgh Medical Center UPMC; = colonisation acquise à l’hôpital avec C difficile détectée par un test de toxine ordonné par le clinicien; = transporteur indéterminé; = autre infection CDI non acquise à l’UPMCa; = récurrent; = carrierc persistante Indique l’ICD attribuable à l’UPMC après le départ de la communauté, le premier test de toxine positive du patient Source a eu lieu le jour de l’étude après avoir eu des cultures de dépistage positives sur les jours,,, et isolement avant le dépistage positif pour C difficileView Large

Epidémiologie moléculaire

Le génotypage MLVA de tous les isolats toxigènes de C difficile dans cette étude a produit des génotypes uniques provenant de patients et d’échantillons environnementaux. Deux cent trente isolats ont formé des complexes d’isolats fortement apparentés STRD ≤ In de complexes, les génotypes apportés par les transporteurs étaient essentiels à la formation du complexe.

Figure Vue largeTélécharger la diapositive Diagraphie minimale illustrant les relations entre les isolats de génotypes par multilocus variable nombre de répétitions en tandem MLVA récupéré à l’Université de Pittsburgh Medical Center UPMC Juillet-Novembre Des isolats en double du même patient sont inclus Les cercles simples représentent le génotype MLVA; les doubles cercles représentent des complexes d’isolats fortement apparentés par MLVA additionné des distances tandem-répétées de ≤, chacun marqué par des désignations majuscules conformes à celles du tableau Les nombres dans chaque complexe / génotype représentent le génotype tcdC Le cercle / taille complexe est proportionnel au nombre de isolats inclus Les complexes marqués en lettres majuscules contiennent des cas d’infection à Clostridium difficile CDI acquis à l’UPMC selon des critères épidémiologiques survenant dans les jours de la période de dépistage; les complexes avec des isolats de cas de HA UPMC associés à l’hôpital seulement des jours avant et après cette période restent non marqués Les complexes et les génotypes sont codés par couleur selon les classifications épidémiologiques: rouge = HA-CDI à l’UPMC; jaune = colonisation détectée par un test de toxine; bleu = colonisation par C difficile détectée lors des tests de dépistage; blanc = isolats environnementaux; vert = toutes les autres infections à C difficile détectées lors des tests de toxine CDI récurrents, CDI acquis par la communauté et HA-CDI non acquis à UPMCFigure View largeTélécharger DiapositiveMinimum Spanning Tree décrivant les relations entre les isolats dans les génotypes par multilocus variable nombre d’analyses de répétitions en tandem Centre médical de l’Université de Pittsburgh UPMC Juillet-novembre Des isolats en double provenant du même patient sont inclus. Les cercles simples représentent le génotype MLVA; les doubles cercles représentent des complexes d’isolats fortement apparentés par MLVA additionné des distances tandem-répétées de ≤, chacun marqué par des désignations majuscules conformes à celles du tableau Les nombres dans chaque complexe / génotype représentent le génotype tcdC Le cercle / taille complexe est proportionnel au nombre de isolats inclus Les complexes marqués en lettres majuscules contiennent des cas d’infection à Clostridium difficile CDI acquis à l’UPMC selon des critères épidémiologiques survenant dans les jours de la période de dépistage; les complexes avec des isolats de cas de HA UPMC associés à l’hôpital seulement des jours avant et après cette période restent non marqués Les complexes et les génotypes sont codés par couleur selon les classifications épidémiologiques: rouge = HA-CDI à l’UPMC; jaune = colonisation détectée par un test de toxine; bleu = colonisation par C difficile détectée lors des tests de dépistage; blanc = isolats environnementaux; vert = toutes les autres infections à C difficile détectées lors des tests de toxicité récidivant de l’IDC, de l’IDC acquis dans la communauté et de l’IDC-HA non acquis à l’UPMC

Figure Vue largeTélécharger la diapositive Diagraphie minimale illustrant les relations détaillées entre multilocus variable nombre de répétitions en tandem Génotypes MLVA dans les complexes M et N Figure Chaque cercle représente le génotype MLVA dont la taille est proportionnelle au nombre d’isolats qui le composent Les nombres entre génotypes indiquent la somme tandem-répétée Les chiffres au sein des génotypes représentent les jours d’étude sur lesquels chaque isolat du génotype a été collecté. Les isolats avec des lettres majuscules A-F indiquent les isolats de patients avec une infection HA C difficile HA-CDI dans le tableau; les isolats de source pour ces cas basés sur l’analyse épidémiologique sont étiquetés par des lettres minuscules correspondantes a-f Un isolat étiqueté e / E est à la fois un isolat de cas CDI associé à l’hôpital ainsi qu’une source pour un cas subséquent Le génotype MLVA indiqué par la flèche montre un exemple d’un génotype C difficile récupéré par des tests de dépistage seulement ce qui était essentiel à la formation d’un complexe. Vue Agrandir la vignetteTélécharger Diapositive minimum illustrant les relations détaillées entre un nombre variable multilocus d’analyses de répétitions en tandem Génotypes MLVA dans les complexes M et N cercle représente le génotype MLVA mis à l’échelle en fonction du nombre d’isolats qui le composent Les nombres entre génotypes indiquent la différence tandem-répétée cumulée entre eux Le codage couleur des génotypes MLVA est conforme à celui de la Figure Les chiffres au sein des génotypes représentent les jours d’étude. le génotype a été recueilli Isolats avec les lettres majuscules A-F indiquent les isolats f des patients atteints d’une infection à HA C difficile HA-CDI énumérés dans le tableau; les isolats de source pour ces cas basés sur l’analyse épidémiologique sont étiquetés par des lettres minuscules correspondantes a-f Un isolat étiqueté e / E est à la fois un isolat de cas CDI associé à l’hôpital ainsi qu’une source pour un cas subséquent Le génotype MLVA indiqué par la flèche montre un exemple de génotype C difficile récupéré par des tests de dépistage seulement qui était essentiel à la formation d’un complexe. Les isolats de cas HA-CDI qui n’étaient pas apparentés à d’autres isolats comprenaient des génotypes tcdC n =, n =, n =, n = , n =, et n = souche épidémique isole le génotype tcdC, ribotype inféré composé de% d’isolats dans cette étude; ceux-ci ont été discriminés par MLVA en génotypes, dont les complexes forment Table; Figure Les isolats de souche épidémique ont été trouvés dans% des porteurs et dans% de patients avec CDI OR; % CI, -; P & lt; Aucune autre différence significative n’a été observée dans la prévalence des souches par un autre génotype tcdC sur différentes classes épidémiologiques. Les données de typage détaillées pour tous les isolats de patients dans cette étude se trouvent dans le tableau supplémentaire.

Sensibilité du dépistage du C difficile et des modes de transport

La sensibilité au champ des cultures de dépistage du C difficile était de% et de% prélevées à des intervalles de – et des jours à partir de la première selle toxique du patient, respectivement. Cent-quatorze cultures de criblage ont été effectuées sur des patients ≥ jours avant leur première toxine. -stable; Parmi eux,% étaient négatifs pour le C difficile,% étaient positifs pour les isolats de C difficile non apparentés et% étaient positifs pour les isolats très apparentés par rapport aux isolats de la première toxine fécale positive du patient. Les isolats hautement apparentés provenaient de patients à des intervalles de – à – jours patients et patients de jours à jours de patients qui ont été examinés & gt; jours après la date de collecte de leurs premiers essais de toxines fécales positives, les patients sont restés positifs pour le C difficile et les patients collectés à cet intervalle sont restés positifs pour le C difficile étroitement lié à l’isolat du premier test de toxine du patient sur des intervalles aussi longs. en jours médian, jours

DISCUSSION

Environ un quart des isolats provenant de cas de HA-CDI étaient fortement apparentés à des isolats de patients asymptomatiques identifiés à partir de tests de dépistage. Cette constatation suggère que le dépistage et l’isolement des patients avec un transport pourraient potentiellement conduire à Certains patients CDI avaient des isolats qui pouvaient être retrouvés par MLVA chez des porteurs ou d’autres patients CDI isolés au moment du dépistage. Ces patients peuvent avoir contaminé l’environnement avant l’initiation de l’isolement ou peuvent représenter une non-conformité aux précautions de contact. Il est concevable qu’un déclenchement précoce de l’isolement pour certaines de ces nouvelles causes par le dépistage du transport du C difficile aurait pu empêcher la propagation. Ces cas auraient nécessité l’hygiène des mains avec de l’eau et du savon en plus des précautions d’isolement existantes.Précautions d’isolement de C difficile pendant la durée de l’hospitalisation Comme% des patients CDI dépistés à & gt; Le programme de surveillance active du C difficile pourrait jouer un rôle dans le choix du moment de l’interruption du contact préventif. Cette étude appuie également l’hypothèse selon laquelle les événements de transmission de l’environnement chez les occupants de la chambre ayant un CDI ou un transport Les surfaces des chambres étaient positives, les génotypes MLVA correspondant étroitement à ceux du porteur chez les patients testés dans cette étude. Malgré l’utilisation du nettoyage universel à l’hypochlorite de sodium, la transmission dans l’environnement peut expliquer les cas incidents d’AH-CDI. étude de Shaughnessy et al, qui a rapporté que l’occupation d’une chambre d’hôpital contenant précédemment un patient CDI est un facteur de risque indépendant pour CDI Dans une étude récente, le personnel d’entretien était inefficace dans la désinfection des chambres contaminées par C difficile. la viabilité indéfinie des spores de C difficile, contamination des pièces éloignées Ces données suggèrent que d’autres recherches comparatives sur l’efficacité de la désinfection hospitalière sont nécessaires. Cette étude suggère que la période d’incubation de l’ICD peut être & gt; Au contraire de la méta-analyse de Shim et al , où seuls les patients porteurs de C difficile ont développé une ICD lors d’une analyse de patients, Ces données suggèrent que la colonisation peut précéder de longue date d’autres facteurs qui précipitent l’ICD, comme les antimicrobiens. Parce que nos cultures de dépistage utilisaient un programme de surveillance existant pour un organisme hospitalier, nous n’avons pas examiné toute la population. à risque pour le transport du C difficile; Des études antérieures ont révélé que les patients sans facteur de risque reconnu de C difficile représentent% -% de la population de porteurs de C difficile De plus, de nombreux patients de cette étude qui présentaient un risque élevé de Nous avons été incapables de suivre les expositions épidémiologiques communes au-delà des salles d’hospitalisation habituelles telles que l’exposition à des tests diagnostiques ou au personnel médical. Ces expositions peuvent prendre en compte les patients identifiés comme non transmissibles ou indéterminés dans cette étude. Walker et al, qui ont montré que le contact en salle avec les patients CDI peut seulement représenter environ% des événements de transmission de CDI en utilisant une méthode de typage moins discriminatoire que MLVA [ ] Dans cette étude, nous avons montré qu’un équilibre substantiel des transmissions provient d’un transporteur asymptomatique s; si l’expansion du dépistage à tous les patients hospitalisés identifierait plus d’événements de transmission ou, inversement, montrer plus de transmissions hors salle est une question de conjecture, mais le grand nombre de cas HA-CDI avec des transmissions hors salle suggère que les spores de C difficile peuvent être largement répandues. En résumé, il pourrait être utile d’effectuer des tests de surveillance pour le transport du C difficile. Un essai contrôlé est nécessaire pour évaluer l’utilité du dépistage du C transport difficile avec incident HA-CDI comme critère d’étude principal

Remarques

Remerciements Nous remercions Jamie L Grey pour son entretien de la base de données de contrôle des infections utilisée dans cette étude. Soutien financier Ce travail a été soutenu par le ministère de la Santé de Pennsylvanie, tous les auteurs et par un prix de recherche de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses. LHH, JWM et KAS reçoivent des fonds de recherche de ViroPharma et Merck CAM siège au bureau des conférenciers de l’Institut Robert Michael et de l’Institut universitaire de médecine Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Les conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués