Trichosporonose invasive causée par Trichosporon asahii et d’autres espèces inhabituelles de trichosporons dans un centre médical à Taiwan

Contexte La trichosporonose invasive a attiré l’attention en tant qu’infection opportuniste de patients immunodéprimés au cours des deux dernières décennies Cependant, aucune série de cas récents n’a été rapportée. Méthodes Tous les patients ayant des cultures positives pour Trichosporon dans un centre médical ont été évalués. Analyse de la région espaceur intergénique du gène de l’ARN ribosomique fongique Les tests de sensibilité in vitro ont été réalisés en utilisant la méthode de microdilution en bouillon. Résultats Une culture positive pour les espèces Trichosporon a été trouvée chez les patients T asahii était le plus fréquemment espèce isolées n =,% =, T montevideense n =, et un chacun des T astéroïdes, T cutaneum, T faecale, et T ovoides Dix-neuf patients avaient des infections invasives:% causé par T asahii et un chacun a provoqué T dermatis, T montevideense et T astéroïdes Parmi les les épisodes de trichosporonose invasive, les épisodes% étaient fungemia, trois% étaient l’infection pulmonaire et un% chacun était une infection des tissus mous et une méningite La plupart des infections invasives étaient associées à une antibiothérapie antérieure%, utilisation du cathéter central%, malignité% et séjour aux soins intensifs% Azoles avait de bonnes activités in vitro alors que l’amphotéricine B et les échinocandines n’étaient pas actives contre Trichosporon isolats Le taux de mortalité toutes causes confondues était de% et était plus élevé chez les patients atteints de malignité% Conclusions Trichosporonose invasive tend à se développer chez les patients atteints de malignité et associée à une mortalité plus élevée T asahii et autres espèces inhabituelles de Trichosporon peuvent provoquer une trichosporonose invasive

Les espèces de Trichosporon sont des habitants du sol et peuvent faire partie de la flore normale de la peau humaine et du tractus gastro-intestinal Les infections invasives dues aux espèces Trichosporon sont rares Cependant, au cours des deux dernières décennies, les espèces Trichosporon sont apparues comme pathogènes opportunistes importants chez les individus immunodéprimés. -] Auparavant, la classification et la nomenclature des espèces de Trichosporon étaient compliquées Une nouvelle nomenclature a donc été proposée basée sur des techniques moléculaires [, -] Le T beigelii, principal pathogène causant les maladies de Trichosporon, fait référence à six espèces, dont T asahii, T cutaneum, T inkin, T asteroides, T mucoides et T ovoides Une autre espèce cliniquement importante, Trichosporon capitatum, avait été précédemment dénommée Blastoschizomyces capitatus T japonicum, d’abord isolée de l’air au Japon, a été récemment rapportée. provoquer une infection chez l’homme Une méthode basée sur la PCR pour l’identification rapide et spécifique du médicament Cette technique incorpore des amorces de PCR conçues à partir de séquences d’ADN dans les régions conservées des exons d’ARNr et amplifie des séquences variables trouvées dans l’espaceur interne transcrit ITS, espaceur intergénique IGS des régions S, S et S fongiques répétées en tandem ARNr, et région D / D des locus du gène S rRNA Cette étude rétrospective a étudié les caractéristiques cliniques, les résultats du traitement et la sensibilité antifongique de la trichosporonose invasive, y compris celles causées par des espèces inhabituelles de Trichosporon dans un centre hospitalier non restreint aux patients cancéreux.

Matériaux et méthodes

Patients et contexte Tous les patients ayant une culture positive pour les espèces de Trichosporon entre mai et mai ont été identifiés dans les archives du laboratoire de microbiologie du National University Hospital de Taiwan. NTUH NTUH est un centre médical affilié à l’université de Taïwan qui fournit des soins médicaux primaires et tertiaires. Les dossiers médicaux de ces patients ont été revus rétrospectivement L’infection fongique invasive a été définie selon la déclaration de consensus du groupe coopératif IFICG des infections fongiques invasives de l’Organisation européenne de recherche et de traitement du cancer EORTC et le groupe d’étude sur les mycoses MSG de l’Institut national des allergies. et maladies infectieuses NIAID Les épisodes répondant aux critères des infections fongiques invasives prouvées ou probables ont été retenus pour les analyses. La culture positive de plusieurs spécimens du même patient pendant la même période d’hospitalisation a été comptée comme un épisode, et les patients ayant une culture positive. sang et autres spécimens Les données démographiques, les schémas thérapeutiques et le résultat de chaque épisode de trichosporonose invasive ont été enregistrés. Les facteurs prédisposants précédemment associés à la trichosporonose invasive ont été inclus dans le formulaire d’enregistrement [,,] Espèces identification Tous les isolats d’isolats de Trichosporon ont été identifiés au niveau de l’espèce par des procédures de laboratoire standard, y compris l’identification morphologique et l’API C bioMérieux Vitek, Marcy l’Etoile, France Séquençage de la région IGS de l’espaceur intergénique ribosomal ADN localisé entre les gènes S et S ARNr ont également été analysés. La région IGS s’étendant de longueur à pb a été amplifiée par PCR en utilisant les amorces suivantes: SF, ‘-ATCCTTTGCAGACGACTTGA-‘, et SR, ‘-AGCTTGACTTCGCAGATCGG-‘ La séquence déterminée a ensuite été comparée aux séquences disponibles dans le GenBank en utilisant le programme BLAST http: // blastncbinlmnihgov / BlastcgiClimate et isola tion des espèces de Trichosporon Pour évaluer la relation entre le climat et l’apparition de trichosporonose ou de cultures positives, la température moyenne à Taipei chaque mois a été obtenue sur le site Web du Bureau météorologique central de Taiwan http: //www.cwbgovtw/Testtifungal tests de sensibilité Tous les Trichosporon BBL Microbiology Systems, Cockeysville, MD, États-Unis, additionné de% de glycérol Avant les tests de sensibilité, les isolats ont été soumis deux fois à la gélose au dextrose de pomme de terre Les concentrations minimales inhibitrices Les CMI des isolats ont été déterminées en utilisant la méthode de microdilution en bouillon de référence et ont été interprétées en suivant les lignes directrices établies dans le CLSI du Clinical and Laboratory Standards Institute; anciennement le document NCCLS MA Les concentrations testées d’agents antifongiques allaient de μg / mL à μg / mL. Les plaques de microdilution étaient incubées à ° C et observées pour la présence ou l’absence de croissance visible à h et h. l’aide d’un miroir de lecture; la croissance dans chaque puits est comparée à celle du puits sans médicament témoin de croissance MIC et MIC indiquent que les CMI auxquelles% et%, respectivement, des isolats ont été inhibésCandida albicans ATCC, Candida parapsilosis ATCC, et Candida tropicalis ATCC ont été utilisés comme souches de contrôle de qualitéAnalyse statistique Les différences de mortalité entre le patient atteint de fongémie et sans fongémie et les patients atteints de tumeur maligne et sans malignité ont été analysées en utilisant la valeur AP du test exact de Fisher de & lt; a été considéré comme statistiquement significatif

Résultats

Isolats fongiques Au cours de la période d’étude, des isolats d’espèces de Trichosporon ont été cultivés à partir de différents échantillons cliniques de patients différents, dont les critères d’infection invasive sont présentés. sites les plus communs produisant des espèces de Trichosporon T asahii étaient les isolats les plus fréquemment des espèces n =,%, suivis par T dermatis n =,%, T montevideense n =,%, et chacun des T astéroïdes, T cutaneum et T faecale Dix-neuf patients Tous ces isolats se sont bien développés sur la gélose de maïs BBL Microbiology Systems et les examens microscopiques ont révélé des hyphes avec la formation d’arthroconidies et de blastoconidies latérales et terminales. isolats, ont été identifiés de manière concordante comme T asahii par les deux analyses de séquençage IGS pleine longueur allant de à bp avec & gt;% id Cependant, des résultats discordants ont été notés parmi les isolats non-asahii Trichosporon par les deux méthodes.

Vue de la table grandDownload slideSpecies distribution, proportion causant une infection invasive, et source d’isolats de TrichosporonTable View largeTouche de téléchargementDistribution des espèces, proportion causant une infection invasive, et source d’isolats de Trichosporon

Tableau View largeTélécharger slideIdentification des isolats non-asahii Trichosporon de patients par l’API C et analyse de séquençageTable View largeTélécharger slideIdentification d’isolats non-asahii Trichosporon de patients par l’API C et analyse de séquençageClimate et trichosporonose La figure montre la température moyenne et l’incidence des espèces de Trichosporon cultivées dans chaque mois L’incidence a atteint un sommet en mai /, les patients admis, qui était au début de l’été dans le nord de Taiwan

Figure View largeTélécharger slideMesure moyenne et incidence par patient admis pour une culture positive de Trichosporon par mois de mai à mai à TaiwanFigure Voir grandTélécharger Diapo et température moyenne, patients admis en culture positive pour Trichosporon par mois de mai à mai à TaiwanCaractéristiques cliniques Les patients atteints de trichosporonose invasive et les patients ayant des cultures positives pour les espèces de Trichosporon sans infecion invasive sont résumés dans le tableau. Parmi ces patients atteints de trichosporonose invasive,% présentaient une infection sanguine,% une infection pulmonaire, un% une infection du système nerveux central et un% des tissus mous. Parmi ces patients,% avaient une antibiothérapie antérieure%,% avaient des cathéters centraux,% avaient une tumeur maligne et% avaient un séjour en USI De plus,% des patients atteints de trichosporonose invasive présentaient également une candidémie au cours d’une même hospitalisation Trois épisodes de trichosporonose invasive c utilisé par Trichosporon non-asahii, incluant une infection de la peau par T dermatis, T asteroids fungemia, et T montevideense méningite

Table View largeTélécharger les caractéristiques cliniques des patients atteints d’infection invasive à Trichosporon et des patients ayant une culture positive mais sans preuve d’infection invasive pour les espèces TrichosporonTable Voir grandDisqueTélécharger Caractéristiques cliniques des patients atteints d’infection invasive à Trichosporon et patients avec culture positive mais sans infection invasive pour les espèces Trichosporon avec des cultures positives avec des espèces Trichosporon sans signe d’infection invasive,% avaient un diabète sucré,% présentaient une malignité sous-jacente,% utilisaient des cathéters centraux et% avaient une utilisation antérieure d’antibiotiques. Traitement et résultat Le traitement et les résultats des patients atteints d’infection invasive à Trichosporon ont été analysés. La mortalité des patients avec et sans épisode fongémique était respectivement de% et de%, et cette différence n’était pas significative p = Mortalité des patients avec et sans tumeur maligne sous-jacente en% et%, respectivement p = Fluconazole a été utilisé comme agent antifongique initial chez% des patients et% des patients ont été traités avec des régimes contenant du fluconazole. Sensibilités antifongiques Les intervalles MIC, MIC et MIC des isolats de Trichosporon à neuf agents antifongiques sont présentés dans le tableau Comme aucun critère d’interprétation du MIC n’est disponible pour les espèces de Trichosporon, les critères d’interprétation des espèces de Candida ont été utilisés comme référence Tous les isolats présentaient des CMI relativement élevées de l’amphotéricine B Les Échinocandines avaient une faible activité in vitro contre les isolats de Trichosporon Fluconazole et autres. les azoles ont eu une bonne activité in vitro contre les isolats de Trichosporon, en particulier le CMI de voriconazole = μg / mL. Pour les isolats contenant plus de fluconazole CMI & gt; μg / mL, le voriconazole a également démontré une bonne puissance CMI ⩽ μg / mL Deux isolats de CMI du fluconazole et de μg / mL, respectivement, appartenaient à T asahii Les profils de sensibilité étaient similaires chez les différentes espèces de Trichosporon et parmi les différents isolats des diverses infections

Tableau View largeTélécharger la sensibilité antifongique des isolats cliniques d’espèces de Trichosporon provenant de patients utilisant la méthode de microdilution en bouillonTable View largeTélécharger diapositiveRéceptivité antifongique des isolats cliniques d’espèces de Trichosporon provenant de patients utilisant la méthode de microdilution en bouillon

Discussion

Cependant, d’autres méthodes d’identification génétique, y compris l’analyse des régions ITS et de la région D / D de l’ARNr S, devraient être réalisées pour identifier la présence probable de nouvelles espèces de Trichosporon parmi nos isolats [, -] Bien que cette série de patients ait confirmé l’importance de plusieurs facteurs de risque d’infections à Trichosporon, y compris la neutropénie, l’utilisation de cathéters centraux, la malignité et le sexe masculin [,,] ,,], nous n’avons trouvé aucun cas associé à une valvulopathie, une chirurgie ou une infection par le VIH Nos résultats selon lesquels la circulation sanguine et les poumons étaient les deux principaux sites d’infection, en accord avec un étude rétrospective antérieure chez des patients italiens couvrant une période d’un an Le développement de la candidémie au cours de la même hospitalisation par% de nos patients atteints de Trichosp envahissante Or, l’infection peut être attribuable à la similitude des facteurs de risque de ces deux maladies Par conséquent, la candidémie pourrait être le signe d’une trichosporonose invasive et vice versa. Une étude plus approfondie des facteurs de risque communs de ces infections est justifiée. environnements humides L’association entre le climat et l’infection à Trichosporon est particulièrement évidente dans les cas d’infection du trichosporon provoqués principalement par la région génitale et la pneumonie d’hypersensibilité au Japon Par contre, on connaît peu le rôle du climat dans d’autres types d’infections à Trichosporon Dans cette étude de Taïwan, nous avons trouvé un groupe d’espèces de Trichosporon cultivées au début de l’été. Ce phénomène ne peut pas être expliqué uniquement par la température car la température moyenne est similaire en octobre. Le mécanisme responsable de cette association pourrait être plus complexe. cycle des champignons, température, humidité et autres facteurs environnementaux Des analyses plus détaillées sont nécessaires pour expliquer l’association entre l’incidence de la trichosporonose invasive et le climatLe traitement optimal de la trichosporonose invasive n’est toujours pas connu car cette maladie est rare et des études cliniques bien conçues n’ont pas été rapportées. Les échinocandines ne sont pas actives contre les isolats de Trichosporon. L’amphotéricine B et la flucytosine sont moins puissantes que les azoles, mais plus puissantes que les échinocandines. Plusieurs études ont rapporté que Le fluconazole était supérieur à l’amphotéricine B contre les isolats de Trichosporon Nos données in vitro suggèrent que les azoles sont la classe antifongique préférée pour la trichosporonose invasive et que le voriconazole est la drogue de choix Des études antérieures suggèrent également d’utiliser le voriconazole pour traiter les infections invasives. trichosporonose [, -], mais ces déductions étaient également basées sur des données cliniques limitées Dans cette étude, l’itraconazole avait un profil de susceptibilité moins favorable que le voriconazole Une infection par percée pendant le traitement par l’itraconazole de trichosporonose hématogène chez des patients cancéreux a également été rapportée. Des échinocandines contre les espèces Trichosporon ont également été observées dans des études précédentes Dans cette étude, la mortalité toutes causes confondues chez les patients atteints de trichosporonose invasive était en% similaire à celle pour la candidémie% pour les albicans C et% pour C glabrata dans notre institution. ,% pour trichosporonose nosocomiale , et inférieur à ceux -% de plusieurs séries précédentes de trichosporonose invasive [,,] Cet écart pourrait être en partie attribuable aux différences dans les populations étudiées. Les études précédentes sur la trichosporonose invasive étaient toutes axées sur le cancer patients tandis que% des patients dans la présente étude n’ont pas eu de cancer Mortalité des patients avec et sans malignité sous-jacente étaient respectivement% et% dans notre série bien que la différence ne soit pas statistiquement significative. En outre, l’étiologie et la susceptibilité de la trichosporonose invasive ont pu changer depuis les études précédentes, qui recrutaient principalement des cas en s, et l’étude En conclusion, dans cette série provenant de Taïwan, non seulement T asahii, mais aussi certaines espèces inhabituelles de Trichosporon pourraient provoquer une trichosporonose invasive. Le système actuel de classification utilisant l’analyse de séquençage permet d’identifier Trichosporon faisable, et il a été recommandé que l’identification des espèces soit tentée pour tous les isolats cliniques pertinents, en particulier dans le futur choix du traitement antifongique pour des espèces de Trichosporon spécifiques avec une résistance démontrable à certains médicaments antifongiques Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: non conflict ts

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: pas de conflits