Facteurs de risque spécifiques au sérogroupe pour l’infection à Escherichia coli productrice de Shiga-toxine en Australie

ContexteLes souches d’Escherichia coli productrices de toxines de higa sont une cause importante de maladies d’origine alimentaire En Australie, les facteurs de risque d’infection STEC n’ont pas été étudiés au niveau nationalMéthodesNous avons réalisé une étude cas-témoins dans les juridictions australiennes. Les cas ont été recrutés à partir de registres de maladies à déclaration obligatoire et les sujets témoins ont été sélectionnés dans des bases de données de contrôle. Les enquêteurs ont recueilli des données sur les maladies cliniques, les aliments consommés et les expositions. Nous avons recruté des patients infectés par le sérogroupe O STEC, des patients infectés par des sérogroupes non O et des sujets témoins. Un patient infecté par le sérogroupe O et infecté par des sérogroupes non O a développé un syndrome hémolytique et urémique. avec STEC O wer Plus susceptibles de manger des hamburgers, de visiter des restaurants, d’avoir déjà utilisé des antibiotiques ou d’être exposés professionnellement à la viande rouge. Les patients infectés par des aliments non-O STEC étaient plus susceptibles de consommer des tranches de poulet ou de corned-beef. Des associations négatives ont été observées pour certains aliments, en particulier les légumes, les fruits et les herbes cultivés dans le pays. Cette étude des facteurs de risque d’infection à STEC par sérogroupe met en évidence les risques associés à la consommation de hamburgers et à la manipulation de viande crue. prévenir les infections, les hamburgers doivent être bien cuits, et les personnes manipulant de la viande crue ou qui ont un contact étroit avec les animaux doivent assurer une hygiène adéquate

L’infection à Escherichia coli STEC causant la Shiga-toxine provoque une gastro-entérite aiguë caractérisée par des crampes abdominales et une diarrhée sanglante Environ% -% des cas de STEC atteints de syndrome hémolytique et urémique, qui peuvent être mortels. Dans les pays industrialisés, le sérogroupe O du STEC est la souche prédominante responsable de l’infection, et de nombreux pays ont mené des études pour identifier les facteurs de risque associés, notamment aux États-Unis , en Écosse. , Canada et Finlande Consommation de hamburgers, de viande hachée et de viande cuite ou tranchée; contact avec des animaux, des fermes ou des excréments d’animaux; et un voyage sont associés à un risque accru d’infection STEC [-, -] Une petite étude cas-témoin australienne en Australie-Méridionale a identifié une association avec la consommation de fraises, de fraises, de mûres et de myrtilles. Depuis, la législation en matière de santé publique en Australie a obligé les laboratoires et / ou les médecins à signaler les infections à STEC aux départements de santé des États et des territoires. Un État australien – l’Australie du Sud – a un taux de dépistage des échantillons de selles pour les STEC par les laboratoires de santé publique et taux de notification par population supérieur à ceux des autres juridictions australiennes Les techniques de diagnostic utilisées pour détecter les STEC varient considérablement selon les laboratoires de santé publique australiens. utiliser la réaction en chaîne de la polymérase Des tests basés sur la PCR qui comprennent des Les taux plus élevés de STEC en Australie méridionale sont probables parce que cette juridiction utilise la PCR pour le diagnostic, qui est plus sensible que la culture , et en raison de l’augmentation du nombre de sérogroupes. des tests effectués En Australie, le sérogroupe O est la souche prédominante de STEC, causant% de toutes les infections En, le gouvernement australien a établi OzFoodNet pour améliorer la surveillance des maladies d’origine alimentaire, y compris l’infection STEC Pour enquêter sur les infections à STEC, OzFoodNet mené une étude cas-témoin sur des patients infectés par le sérogroupe O et tous les autres sérogroupes non O

Méthodes

Étudier le design

Nous avons réalisé une étude cas-témoins d’infections sporadiques à STEC entre juillet et avril dans les états et territoires en Australie. L’approbation éthique a été obtenue par les comités d’éthique régionaux ou locaux. L’Australie du Sud a commencé à recruter des patients en juillet. en janvier

Population étudiée

Cas Les médecins et les laboratoires ont été tenus par la loi de santé publique de notifier les cas d’infection STEC dans toutes les juridictions australiennes pendant la période d’étude. Les cas admissibles étaient des patients diagnostiqués avec une infection STEC dont les cas ont été notifiés aux départements sanitaires de l’état ou du territoire. Les toxines de Shiga ont été détectées dans les fèces, ou les gènes associés à la production de toxine STEC stx ou stx ont été détectés par des tests d’acides nucléiques, par exemple, la PCR d’un isolat de E. coli ou directement dans la diarrhée sanglante. comme sérogroupe O sur la base d’un résultat positif du test PCR ou de la culture Tous les autres cas ont été classés sérogroupes non-O Des méthodes australiennes de détection en laboratoire ont été décrites ailleurs La détermination du sérogroupe a été réalisée par PCR multiplex pour les sérogroupes O communs, O, et O ou par sérotypage traditionnel utilisant les antigènes O et H Les patients cas ont été exclus s’ils avaient une co-infection avec un d’autres agents pathogènes ayant voyagé à l’étranger le mois précédent, ayant eu une autre personne dans leur ménage infectée par STEC ou ayant souffert de diarrhée le mois précédent, fait partie d’une éclosion de STEC, n’avait pas de diarrhée ou étaient incapables de se rappeler lorsque la diarrhée a commencé. interviewé dans les jours suivant l’apparition de la maladie, avait un délai de ⩾ jours entre le début de la diarrhée et la collecte d’un échantillon de selles, ou n’avait pas de téléphone ou était inaccessible après les tentatives Toutes juridictions sauf le Territoire du Nord et la Tasmanie -Queensland et Nouvelle-Galles du Sud-ont des unités de santé publique régionalisées qui ont fourni des données à cette étude couvrant respectivement% et% de leurs populations respectives. Contrôles Trois sujets témoins par patient ont été recrutés, si possible, dans des bases de données de contrôle dans chaque juridiction. groupes d’âge, sauf ceux qui sont âgés de moins de 18 ans; Les bases de contrôle proviennent de recherches antérieures dans lesquelles les participants ont indiqué qu’ils souhaitaient être contactés pour des enquêtes supplémentaires. Les sujets témoins ont été exclus si eux ou une autre personne de leur ménage avaient une maladie gastro-intestinale dans les semaines précédant l’enquête. l’entrevue, avait voyagé à l’étranger le mois précédent, n’avait pas de téléphone ou était inaccessible après les tentatives, ou n’avait pas été interviewé dans les jours suivant le signalement du cas au ministère de la Santé

Questionnaire

Un questionnaire structuré administré par téléphone a été utilisé pour collecter des informations sur la démographie, la santé et l’exposition, et des questions supplémentaires ont été posées aux patients sur l’évolution clinique de leur maladie et de leur traitement. apparition de la maladie; les sujets témoins ont été interrogés sur les jours précédant l’interview Pour les expositions environnementales, les patients et les sujets témoins ont été interrogés sur les semaines précédentes avant le début de la maladie et l’interview, respectivement

L’analyse des données

L’ensemble de données a été divisé en groupes pour l’analyse basée sur le sérogroupe O ou non O et pour la comparaison avec les contrôles Des analyses descriptives, univariées et multivariées ont été effectuées en utilisant STATA Intercooled, version Stata Corp Toutes les variables avec des valeurs P ont été incluses dans des modèles multivariés pour Évaluation complémentaire Expositions avec & lt; L’analyse multivariée a été réalisée à l’aide d’une régression logistique progressive inverse et le test du rapport de vraisemblance a déterminé quelles variables étaient exclues à chaque étape. L’âge, le sexe et l’état de résidence ont été considérés comme des variables de conception. dans le modèle final

Résultats

Population étudiée Il y a eu des cas d’infection à STEC notifiés en Australie pendant la période d’étude Vingt-deux pour cent des cas étaient dans des états ou des territoires n’ayant pas participé à l’étude et% n’étaient pas éligibles. Les cas de patients recrutés pour l’étude représentaient% de tous les cas notifiés d’infection à STEC en Australie au cours de la période d’étude, et% de toutes les notifications d’infection STEC dans les pays participants. Les cas non éligibles ont été exclus, les cas d’étude représentaient% des notifications d’infection STEC éligibles Les raisons de l’inéligibilité des patients étaient: patients co-infectés, voyages récents, coinfection et voyage, personne malade dans le ménage, épidémie définie de STEC, pas de diarrhée ou début incertain, aucune entrevue dans les jours suivant la maladie, et ⩾ jours entre le début de la diarrhée et la collecte des selles Les patients ont été co-infectés avec des patients de Campylobacter, Salmonella, Shigella, Yersinia, Cryptosporidium, Aeromonas et Plesiomonas speciesParticipants Nous avons recruté des cas de patients infectés par STEC sérogroupe O, des cas de patients infectés par des sérogroupes non O et des sujets témoins. Les patients du sud de l’Australie infectés par O, infectés par des non-O, et les sujets témoins en raison de la durée plus longue du recrutement et du taux plus élevé de dépistage des échantillons de selles dans cet état. Il n’y avait pas de différence entre les patients infectés par O et ceux infectés par un non-O par rapport à toutes les caractéristiques démographiques, sauf que les patients infectés par O étaient significativement plus susceptibles d’être des femmes P = et étaient moins susceptibles de parler une langue autre que l’anglais à la maison P = Il n’y avait aucune différence entre les patients infectés par STEC O et les sujets témoins en ce qui concerne les caractéristiques démographiques, mais significativement Les proportions de cas de patients infectés par un non-O étaient indigènes ou parlaient une langue autre que l’anglais à la maison, comparé à la table des sujets témoins.

Tableau View largeDownload slideCaractéristiques des patients cas infectés par des sérogroupes et sérogroupes O-sérogroupe O et non-O producteurs de Shiga-toxine en Australie, -Table View largeTélécharger slideCaractéristiques des cas de patients infectés par Escherichia coli producteur de Shiga sérogroupe O et non-O sérogroupes et sujets témoins en Australie, les cas non-O comprennent les cas d’infection par le sérogroupe O, les cas d’infection par le sérogroupe O et les cas d’infection par les sérogroupes O, OR: sérogroupe H, O et OA n’ont pas pu être déterminés. En outre, il y a eu des cas pour lesquels le sérogroupe n’a pas été testé ou était inconnu. Un gène positif de Shiga-toxine a été détecté en% de cas non-O, avec% positif pour stx et stx,% positif pour stx seulement, et% positif pour stx seulement Parmi les cas O, un gène de toxine positif a été détecté en%, avec% positif pour stx et stx,% positif pour stx seulement, et% positif pour stx sur Tous les patients infectés par O ont signalé un taux de leucémie élevé dans les selles, ce qui était significativement plus élevé que celui rapporté par les patients non infectés. avec OP = La proportion de patients déclarant tous les autres symptômes était similaire pour les sérogroupes O et non O. La durée médiane de la diarrhée chez les patients infectés par O était de plusieurs jours, – jours, comparé à une médiane de jours pour les patients infectés. avec plage non-O, – jours; P = La moitié des patients infectés par O ont été hospitalisés pendant une durée médiane, des nuits à l’hôpital; intervalle, – nuits, comparé au% des patients cas infectés avec une durée médiane non-O, nuits à l’hôpital; gamme, – nuits; P =

Vue de la table grandDownload slideSymptômes rapportés par les patients cas infectés de sérogroupes O et non-O productrices de Shiga-toxines Escherichia coli en Australie, -Table View largeDownloadSymptômes rapportés par les patients cas infectés par Escherichia coli producteur de Shiga sérogroupe O et sérogroupes non-O En Australie, un patient infecté par O% et un patient non infecté par O ont reçu un diagnostic de syndrome hémolytique et urémique. P = Les sérogroupes non-O entraînant un syndrome hémolytique et urémique étaient des cas O, O, O, OU : Cas H et cas non typables L’âge médian des patients atteints du syndrome hémolytique et urémique était de plusieurs années, et le rapport hommes-femmes était: Lorsque les patients atteints du syndrome hémolytique et urémique étaient comparés à tous les autres cas, il n’y avait pas de différence significative dans l’utilisation des médicaments P = ou des antibiotiques P = ou dans les maladies chroniques P = avant le diagnosticAnalyse multivariée Dans l’analyse univariée, l’infection par E coli s L’association d’un hamburger à un restaurant ou à un événement organisé était associée à une maladie, comme dans le cas d’un autre membre du ménage exposé à la viande rouge crue. L’utilisation antérieure d’antibiotiques était associée à une infection par le sérogroupe O les légumes, les fruits ou les herbes cultivés sur place étaient négativement associés à l’infection O

Tableau View largeTélécharger Diapositive Analyse des facteurs de risque d’infection à Escherichia coli productrice de Shiga sérogroupe O et non O sérogroupe pour les aliments consommés dans les jours et les expositions environnementales dans les semaines avant la maladie pour les patients et avant l’entrevue pour les sujets de contrôle en Australie, -Table View largeDownload slideAnalyse multidimensionnelle des facteurs de risque d’infection par le sérogroupe O et les sérogroupes non O producteurs de Shiga-toxine pour les aliments consommés dans les jours et les expositions environnementales dans les semaines précédant la maladie chez les patients et avant l’interview chez les sujets témoins en Australie Les patients infectés par des sérogroupes non-O d’E. Coli étaient plus susceptibles d’avoir mangé lors d’un événement traiteur ou d’avoir mangé du poulet, de la viande ou du corned beef acheté chez un traiteur. Les patients étaient également plus susceptibles d’avoir campé dans la brousse. ou a eu un membre de la famille qui a travaillé avec des animaux, ou a vécu sur ou visité une ferme Des associations négatives ont été observées avec manger du porc; oeufs dans les jours précédant la maladie; légumes crus; légumes, fruits et herbes cultivés sur place; ou sous forme de buffet ou de buffet Une analyse multivariée des patients infectés par E. coli sérogroupe O, par rapport à tous les sujets témoins, a montré des résultats similaires à ceux de tous les cas infectés par des sérogroupes non O. centres odds ratio,; % intervalle de confiance, -, manger fruits et légumes odds ratio,; % intervalle de confiance, -, et ayant un membre de la famille qui a travaillé avec les animaux odds ratio ,; % d’intervalle de confiance, -Analyse multivariée Pour les patients infectés avec O, variables en plus du groupe d’âge, le sexe et l’état de résidence ont été inclus dans le modèle Manger à un point de vente hamburger n’a pas été inclus, car il était fortement corrélé avec les hamburgers Après régression pas à pas par étapes, nous avons exclu les variables qui considéraient le contact avec les excréments d’animaux de compagnie, un membre du ménage ayant un contact professionnel avec un animal et vivant sur ou visitant une table de ferme. O étaient significativement plus susceptibles d’avoir eu une exposition professionnelle à la viande rouge crue, des antibiotiques utilisés dans les semaines précédant la maladie, mangé un hamburger et visité un restaurant. L’infection par le sérogroupe O était négativement associée à la consommation de fruits cultivés localement. légumes et herbes

Tableau View largeTélécharger une analyse multivariée des facteurs de risque d’infection par Escherichia coli sérogroupe O productrice de Shiga pour les aliments consommés dans les jours et les expositions environnementales dans les semaines avant la maladie pour les patients et avant l’entrevue pour les sujets témoins en Australie, -Table Voir grand analyse des facteurs de risque d’infection par Escherichia coli sérogroupe O productrice de Shiga pour les aliments consommés dans les jours et les expositions environnementales dans les semaines précédant la maladie pour les patients et avant l’entrevue pour les sujets témoins en Australie, -Pour l’analyse des cas infectés -O sérogroupes, les variables ont été incluses dans le modèle, en plus du groupe d’âge, du sexe et de l’état de résidence. Après régression par étapes, nous avons exclu les variables qui considéraient manger dehors et vivre sur une table de ferme. infectés par des sérogroupes non-O étaient plus susceptibles d’avoir travaillé ou Le membre travaillait avec des animaux, mangeait de la viande de poulet tranchée ou du corned-beef provenant d’une épicerie fine, campait dans la brousse et mangeait lors d’un événement traiteur. L’infection par sérogroupes non-O était négativement associée à la consommation de porc, légumes crus et légumes cultivés ou des herbes

Table View largeTélécharger une analyse multivariée des facteurs de risque d’infection par des sérogroupes non-O d’Escherichia coli producteurs de Shiga, des aliments consommés dans les jours et des expositions environnementales dans les semaines précédant la maladie chez les patients et avant l’interview des sujets témoins en Australie, -Table View largeTélécharger une diapositive Analyse multivariée des facteurs de risque d’infection par des sérogroupes Escherichia coli non-O productrices de shigatoxines, des aliments consommés dans les jours et des expositions environnementales dans les semaines précédant la maladie chez les patients et avant l’interview des sujets témoins en Australie, –

Discussion

Les facteurs de risque pour les patients infectés par des sérogroupes non O étaient différents de ceux identifiés pour les patients infectés par O et incluaient une exposition professionnelle aux animaux, la consommation de viande de poulet transformée tranchée, le camping en brousse en Australie, Les différentes associations observées pour l’infection O et l’infection non O peuvent refléter les réservoirs hôtes respectifs pour ces sérogroupes. Dans les analyses univariées, chaque facteur de risque individuel représentait <% des cas, qui met en évidence le fait que de multiples facteurs sont responsables des infections non-O Le contact animal au travail est cohérent avec les résultats des sérogroupes non-O de E. coli chez les animaux domestiques, en particulier les ruminants L'association avec le camping dans le bush australien peut être liée à une série de facteurs, y compris la mauvaise préparation des aliments, boire de l'eau contaminée, nager dans de l'eau contaminée, contact avec des animaux sauvages et manque d'installations de lavage Bien que la viande de poulet tranchée et le corned beef n'aient jamais été signalés comme facteurs de risque d'infection non O, d'autres études ont signalé une association avec O et des viandes cuites et / ou tranchées d'un traiteur. ] et le poulet rare Bien que les cas d'infection par STEC non O représentent près des deux tiers des cas de cette étude, les infections dues à ces sérogroupes ne sont pas aussi bien étudiées que celles dues au sérogroupe O STEC, bien que non O les sérogroupes sont aussi fréquents ou plus fréquents que le sérogroupe O en Europe et aux États-Unis Cela peut être dû aux difficultés de dépistage des sérogroupes non O, pour lesquels des méthodes non culturales sont requises, ou parce que les sérogroupes non O surviennent en même temps que le sérogroupe O mais seul O est détecté Par exemple, dans une vaste épidémie de syndrome hémolytique et urémique en Australie-Méridionale causée par le sérogroupe O, les sérogroupes O et O ont également été retrouvés chez des patients Mettwurst La source de cette flambée et les échantillons impliqués comprenaient également une gamme de différents organismes STEC Il se peut que si le sérogroupe O est détecté en premier, le dépistage d'autres sérogroupes non-O ne peut pas être fait pour les sérogroupes O et non-O, la consommation de des légumes crus et / ou des fruits, légumes ou herbes cultivés localement étaient négativement associés à l'infection, ce qui a été observé dans des études antérieures sur l'infection à E. coli sérogroupe O Une explication possible pourrait être une plus forte probabilité de consommation de Il existe d'autres explications possibles: les fruits et légumes ont des niveaux élevés d'antioxydants et de caroténoïdes, ce qui pourrait renforcer l'immunité générale, ou qu'un régime alimentaire de fruits et de légumes pourrait affecter la microflore intestinale, ce qui peut altérer susceptibilité de l'hôte à l'infection Il est nécessaire de poursuivre les recherches dans ce domaine, étant donné la fréquence avec laquelle ces associations négatives sont observées dans les cas-témoins. l études sur les pathogènes entériques, comme la campylobactériose et la salmonellose Notre étude comporte plusieurs limites potentielles, dont beaucoup sont liées aux différences de surveillance des STEC en Australie. La proportion plus élevée de cas d'Australie-Méridionale incluse dans notre étude reflète l'augmentation du dépistage des selles sanglantes et l'utilisation de la PCR pour le diagnostic dans cet état Ceci suggère que tous les cas d'infection STEC ne sont pas diagnostiqués dans d'autres juridictions où ces pratiques de diagnostic ne sont pas en place. une plus grande proportion de cas inclus dans cet état Beaucoup de cas ne sont pas caractérisés au-delà des sérogroupes les plus courants, inclus dans le groupe non-O pour l'analyse Laboratoires couramment utilisés pour les panels PCR identifiant au moins le sérogroupe O et d'autres sérogroupes communs biais en incluant dans le groupe non-O des cas qui n'ont pas été testés ogroupes, bien que l'analyse sans ces cas n'affecte pas les résultats résultats non montrés Les facteurs de risque identifiés pour l'infection non-O peuvent ne pas refléter ceux pour les sérogroupes non-O spécifiques Deux juridictions australiennes plus petites n'ont pas participé à cette étude, bien qu'ils aient rapporté & lt; En dépit de ces limites, nous croyons que les résultats de cette étude sont généralisables aux infections à STEC en Australie. Cette étude souligne que les facteurs de risque d'infection à STEC en Australie sont spécifiques au sérogroupe, bien que le contact avec les animaux et les repas à l'extérieur soient communs Groupes L'éducation destinée aux personnes qui vivent ou travaillent avec des animaux ou de la viande crue, en particulier dans les fermes, ainsi que ceux qui aiment camper, peut réduire l'incidence des infections à STEC Bien que le risque absolu d'infection par E. coli sérogroupe O provienne de la consommation de hamburgers est considéré comme faible en Australie, il est important d'éduquer les consommateurs et les manipulateurs d'aliments à bien cuisiner les hamburgers.

Remerciements

Nous remercions les membres du personnel du département de la santé de l’état et du territoire, pour la collecte de données, et les sujets d’étude, pour leur participation à cette étude. Soutien financier Gouvernement australien Département de santé et vieillissement sous le programme de travail OzFoodNet Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: no conflict |

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