Des issues sévères sont associées à des épidémies de génotype 4 de génotype 4: une revue systématique de littérature

Contexte Les norovirus sont la cause la plus fréquente de gastro-entérite épidémique; Ce rapport examine les rapports publiés sur les éclosions de NoV pour quantifier les taux d’hospitalisation et de mortalité et évaluer leur relation avec l’établissement de l’éclosion, la voie de transmission et les méthodes de la souche. Utilisation d’une série de termes relatifs au «norovirus» et «épidémie», nous 2435 articles non identifiés identifiés dans PubMed, EMBASE et Web of Knowledge publiés entre Janvier 1993 et ​​Juin 2011 Les critères d’inclusion inclus des flambées avec un minimum de 2 personnes malades avec une exposition commune et au moins 1 chaîne de polymérase de transcription inverse cas confirmés par la réaction de la maladie NoV Des analyses univariées ont été effectuées, et des modèles multivariés ont été ajustés pour estimer l’effet indépendant de chaque facteur.Résultats Nous avons analysé 843 éclosions de NoV rapportées dans 233 articles publiés dans 45 pays Sur la base de 71 724 maladies, 501 hospitalisations et 45 décès , hospitalisation globale et rat de mortalité Les résultats étaient respectivement de 054% et 006%. En analyse multivariée, les souches de génotype 4 du génotype 4 GII4 NoV étaient associées à un taux d’incidence d’hospitalisation plus élevé [IRR], 94; Intervalle de confiance à 95% [IC], 61-144; P & lt; 001 et taux de mortalité IRR, 31; IC à 95%, 13-76; P = 01 Les décès étaient beaucoup plus susceptibles de survenir dans les éclosions survenues dans les établissements de santé. IRR, 60; IC à 95%, 6-109; P = 01Conclusions Notre étude suggère que les hospitalisations et les décès étaient plus probables dans les éclosions associées aux virus GII4, indépendamment des autres facteurs, et souligne l’importance de développer des vaccins contre les virus GII4 pour prévenir les maladies graves

Les norovirus sont la cause la plus fréquente de gastro-entérite épidémique et une cause majeure de maladies d’origine alimentaire [1] Les norovirus sont responsables d’environ 50% de toutes les flambées de gastroentérites signalées aux États-Unis et dans les pays européens, 36% -59%. Des gastroentérites nocturnes sont généralement bénignes et disparaissent sans intervention médicale. Cependant, des cas graves, y compris l’hospitalisation et la mort, ont été signalés dans des populations plus vulnérables, comme les jeunes enfants, les personnes immunodéprimées et les personnes âgées en établissement [3, 4]. l’impact relatif des facteurs individuels sous-jacents à une maladie grave est mal compris et difficile à démêler lors d’éclosions individuelles ou d’un petit nombre de foyers. Par exemple, les effets graves sont plus fréquents chez les résidents des établissements de soins de longue durée, mais ces éclosions sont également disproportionnées. causée par les virus GII4 du génotype 4 du génogroupe 2 et transmise d’une personne à Pour cette raison, il a été difficile de déterminer si les caractéristiques de l’hôte, la source des infections susceptibles d’affecter la taille de l’inoculum ou les caractéristiques du virus prédisposent les personnes touchées par la maladie à des résultats plus sévères. quantifier les taux d’hospitalisation et de mortalité dans les éclosions de NoV et évaluer leur relation avec l’établissement de l’éclosion, la voie de transmission et la souche

Méthodes

Identification de l’article

Nous avons effectué une recherche documentaire pour les articles publiés entre janvier 1993 et ​​juin 2011 pour les termes «norovirus» et «épidémie» en utilisant PubMed, EMBASE, et Web of Knowledge. Les termes en-tête ont été développés dans PubMed lorsqu’ils étaient disponibles et les opérateurs booléens toutes les formes de terme possibles, aboutissant à la chaîne de recherche finale: norovirus OU norovirus OU calicivirus OU calicivirus OU Caliciviridae OU virus Norwalk OU virus Norwalk OU virus de type Norwalk OU virus de type Norwalk OU virus de type Norwalk OU virus de type Norwalk OU petit rond structuré virus OU petits virus à structure ronde OU petit virus à structure ronde OU petits virus à structure ronde OU SRSV ET éclosion OU éclosions OU pandémie OU pandémie OU épidémie OU épidémie OU éclosion d’une maladie infectieuse OU éclosion d’une maladie infectieuse OU éclosion OU éclosion d’une maladie

Filtrage d’article

La recherche bibliographique initiale a identifié 2435 articles non dupliqués Deux évaluateurs ont indépendamment évalué chaque article pour inclusion Les articles devaient répondre aux cinq critères suivants: 1 être publié dans un format d’article par exemple, les citations de résumés de conférence ont été exclues, 2 être entièrement publié en anglais, 3 décrivent des éclosions de NoV chez l’humain, 4 ont un minimum de 2 cas de maladie associés à une exposition commune et ont au moins 1 cas de chaque éclosion de NoV confirmée par RT-PCR par transcription inverse, et 5 indiquent explicitement le nombre de cas primaires Les articles n’étaient pas admissibles s’ils étaient principalement des revues de NoV, des essais expérimentaux, des études cas-témoins, des cas sporadiques documentés de NoV, ou ont été publiés avant le développement de la méthodologie RT-PCR pour la détection de NoV en 1992. sur des foyers individuels, pas des données agrégées Des flambées de n’importe quelle durée ont été incluses dans notre analyse Divergences entre chaque Deux études ont été résolues par consensus ou par un troisième chercheur Plutôt que d’imposer une définition uniforme des cas, nous avons adopté la définition de cas de chaque auteur. Les épidémies signalées dans plusieurs publications n’ont été enregistrées qu’une seule fois. 5]; ici, nous considérons l’établissement de l’éclosion, la voie de transmission et la souche NoV

Abstraction de données

Une fois l’éligibilité établie, deux examinateurs ont extrait indépendamment les données des articles sélectionnés à l’aide d’une liste de contrôle normalisée et les divergences ont été corrigées par consensus Les informations suivantes ont été extraites: caractéristiques de la publication année, titre, pays Lorsque plusieurs publications ont fait état de la même population d’étude, nous avons utilisé l’article qui a fourni les données les plus récentes et les plus complètes sur les éclosions où de multiples agents pathogènes ont été identifiés dans un cas http://vardenafilonline.org. les patients ont été exclus de cette analyse Si aucune hospitalisation ou décès n’a été signalé, nous avons supposé qu’il n’y en avait aucun causé par l’éclosion

Définitions opérationnelles

Les paramètres de l’éclosion ont été définis comme établissements de soins de santé, hôpitaux, établissements de soins de longue durée ou établissements communautaires (restaurants, écoles, hôtels, etc.). Pour l’analyse des taux d’hospitalisation, les éclosions hospitalières ont été exclues. , de personne à personne ou une combinaison de ces voies La souche NoV a été définie comme étant la souche de NoV prédominante identifiée parmi les individus affectés pendant l’enquête sur l’épidémie et classée comme souches GII4, souches non GII4 ou souches mixtes. pour être GII mais aucun type spécifique n’a été signalé, nous avons exclu cette éclosion de l’analyse N = 97 parce qu’il n’a pas été possible de déterminer si une souche GII4 ou une autre souche GII a causé l’éclosion

Analyses statistiques

Nous avons utilisé un modèle de régression de Poisson gonflé zéro pour générer des estimations regroupées de la proportion de cas hospitalisés ou morts dans une éclosion. Par la suite, des modèles de régression de Poisson séparés avec un terme à effets aléatoires pour tenir compte de la variabilité interétude ont été utilisés. réglage, mode de transmission et tension sur les hospitalisations et les décès, respectivement. Premièrement, les analyses univariées ont été effectuées en fonction de l’éclosion, de la voie de transmission et de la souche de l’éclosion; Une variable indicatrice a été créée lorsque les données sur l’établissement, le mode de transmission ou la déformation étaient manquantes, de sorte que toutes les données pouvaient être incluses dans les modèles multivariés. Les résultats ont été qualitativement similaires aux modèles présentés en utilisant les données de tous les foyers, sauf que la convergence du modèle n’a pas pu être atteinte dans le modèle de mortalité multivariée Toutes les analyses ont été effectuées en utilisant la version 11 de STATA. StataCorp 2009

RÉSULTATS

Parmi ces foyers, 560 66% ont eu lieu en milieu communautaire et 219 26% sont survenus dans des établissements de soins de santé, 370 44% ont eu des transmissions d’origine alimentaire et / ou hydrique et 136 16% avaient seulement une transmission de personne à personne et 293 35% étaient causées par des souches non GII4 alors que 184 22% étaient causées par des souches GII4 Des 219 éclosions dans les établissements de soins, 112 étaient dans des établissements de soins de longue durée et 107 dans les hôpitaux Le nombre d’hospitalisations et de décès a été signalé dans 82 et 47 éclosions, respectivement. Sur un total de 71 724 cas 69 857 provenant de milieux non hospitaliers, 501 hospitalisations et 45 décès, les taux d’hospitalisation et de mortalité étaient de 54 pour 10 000 % d’intervalle de confiance [IC], 45-63 et 6 pour 10 000 cas IC à 95%, 0-39, respectivementEn analyse univariée, les taux d’hospitalisation étaient plus élevés dans les éclosions dans les établissements de soins de santé, y compris les soins de longue durée. les éclosions de lite, mais pas les épidémies hospitalières, que dans le cadre du rapport des taux d’incidence des contextes communautaires [IRR], 15; IC à 95%, 12-19; P & lt; 001, plus élevé dans les épidémies causées par GII4 que par les souches non-GII4 NoV, à l’exclusion des infections mixtes GII IRR, 10; IC à 95%, 7-16; P & lt; 001, et similaire dans les épidémies de personne à personne par rapport aux épidémies d’origine alimentaire et d’origine hydrique IRR, 12; IC à 95%, 10-14; P = 08 Des associations très similaires ont été trouvées dans l’analyse multivariée En considérant seulement les établissements de santé, les taux d’hospitalisation étaient plus élevés dans les éclosions causées par les souches GII4 comparativement aux éclosions causées par les souches non GII4 IRR, 14; IC à 95%, 5-42; P & lt; 001 Les taux de mortalité étaient considérablement plus élevés dans les éclosions dans les établissements de santé que dans les milieux communautaires. IRR, 147; IC à 95%, 20-1090; P & lt; 001, foyers de transmission de personne à personne par rapport aux foyers d’origine alimentaire ou hydrique IRR, 59; IC à 95%, 8-444; P & lt; 001, et dans les flambées de GII4 que dans les flambées de non-GII4 IRR, 10; IC à 95%, 4-25; P & lt; 001 En analyse multivariée, l’ampleur de l’association a diminué avec les établissements de soins de santé IRR, 60; IC à 95%, 6-609; P = 001, diminué avec les éclosions de GII4 IRR, 31; IC à 95%, 13-76; P = 01, et est devenu non significatif dans les épidémies transmises de personne à personne IRR, 28; IC à 95%, 3-28; P = 37 Tableau 1 En ne tenant compte que des établissements de soins de santé, les taux de mortalité étaient plus élevés dans les éclosions causées par des souches GII4 que dans les éclosions causées par des souches non GII4 IRR, 61l; IC à 95%, 20-183; P = 001

Tableau 1Analyse multidimensionnelle et multivariée des taux d’hospitalisation et de mortalité par cadre, type de transmission et analyse univariée par souches Analyse multivariée N = 736a Hospitalisations Foyers Cas Hospitalisations Taux d’hospitalisation brut par 1000 cas Hospitalisation IRR 95% CI P Valeur Hospitalisation IRR 95% CI P Milieu communautaire 560 52 548 391 7 1 … 1 … Établissement de santéb 112 6784 100 15 15 12-19 & lt; 001 14 10-18 02 Inconnu 64 8053 10 1 008 04-15 & lt; 001 06 2-13 16 Transmission Nourriture / eau 370 33 424 284 9 1 … 1 … de personne à personne 109 13 999 192 14 12 10-14 08 10 8-13 81 Mixte / inconnue 257 19 962 25 1 006 04-11 & 001 007 03-14 & lt; 001 Strain Non-infections GII4 277 16 046 33 2 1 … 1 … infections GII4 135 17 654 99 6 10 7-16 & lt; 001 94 61-144 & lt; 001 Mixte / inconnu 324 33 685 369 11 5 3-7 & lt; 001 76 52 109 & lt; 001 Décès Analyse univariée Analyse multivariée N = 843a Flambées Cas Décès Mortalité brute Taux par 100 000 cas Mortalité IRR 95% IC P Valeur Mortalité IRR 95% CI P Valeur Paramètre Milieu communautaire 560 52 548 1 2 1 … 1 … Établissements de santé 219 11 123 44 396 147 20-1090 & 001 60 6-609 001 Inconnu 64 8053 0 … … … … … Transmission Nourriture / eau 370 32 633 1 3 1 … 1 … de personne à personne 136 16 234 44 271 59 8-444 & lt; 001 28 3-280 37 Mixte / inconnu 337 22 857 0 … … … … … Strainc Non-infections GII4 293 16 594 6 36 1 … 1 … infections GII4 184 20 213 28 139 10 4-25 & lt; 001 31 13-76 01 Mixte / inconnu 366 34 917 11 32 07 3-19 51 13 47-364 60 Analyse univariée Analyse multivariée N = 736a Hospitalisations Foyers Cas Hospitalisations Taux d’hospitalisation brut pour 1000 cas Hospi talization IRR 95% CI P Valeur Hospitalisation IRR 95% CI P Valeur Réglage Milieu communautaire 560 52 548 391 7 1 … 1 … Établissement de santéb 112 6784 100 15 15 12-19 & lt; 001 14 10-18 02 Inconnu 64 8053 10 1 008 04-15 & lt; 001 06 2-13 16 Transmission Nourriture / eau 370 33 424 284 9 1 … 1 … De personne à personne 109 13 999 192 14 12 10-14 08 10 8-13 81 Mixte / inconnu 257 19 962 25 1 006 04-11 & 001 007 03-14 & lt; 001 Strain Infections non-GII4 277 16 046 33 2 1 … 1 … Infections GII4 135 17 654 99 6 10 7-16 & lt; 001 94 61-144 & lt; 001 Mixte / inconnu 324 33 685 369 11 5 3-7 & lt; 001 76 52-109 & lt; 001 Décès Analyse univariée Analyse multivariée N = 843a Flambées Cas Décès Mortalité brute Taux pour 100 000 cas Mortalité IRR 95% CI P Valeur Mortalité IRR 95% CI P Valeur Réglage Paramètres communautaires 560 52 548 1 2 1 … 1 … Établissements de soins de santé 219 11 123 44 396 147 20-1090 & 001 60 6-609 001 Inconnu 64 8053 0 … … … … … Transmission Nourriture / eau 370 32 633 1 3 1 … 1 … de personne à personne 136 16 234 44 271 59 8-444 & lt; 001 28 3-280 37 Mixte / inconnu 337 22 857 0 … … … … … Strain Infections non-GII4 293 16 594 6 36 1 … 1 … Infections GII4 184 20 213 28 139 10 4-25 & lt; 001 31 13-76 01 Mixte / inconnu 366 34 917 11 32 07 3-19 51 13 47-364 60 Abréviations: IC, intervalle de confiance; GII4, génogroupe 2 génotype 4; Les résultats ont été qualitativement similaires aux modèles présentés en utilisant les données de tous les foyers, sauf que la convergence du modèle n’a pas pu être établie. dans le modèle de mortalité multivariéeb Les éclosions hospitalières ont été exclues de l’analyse des hospitalisations associées à une éclosionc Sur 843 éclosions, 696 83% ont signalé le génogroupe de norovirus identifié comme étant la cause étiologique de la flambée.

DISCUSSION

De manière générale, les seuls foyers de cette analyse qui ont été signalés dans un contexte de faible revenu en Afghanistan ou à revenu moyen inférieur en Irak se sont produits parmi les forces militaires américaines et britanniques; Cependant, on pense que le fardeau de la maladie NoV est le plus élevé dans les régions en développement. [3] Étant donné que les mauvais résultats sont liés à un accès insuffisant aux soins médicaux, nos chiffres peuvent sous-estimer le véritable taux d’hospitalisation et de mortalité. Les taux élevés d’hospitalisation dans les établissements de soins de longue durée et la mortalité dans tous les établissements de santé soulignent la vulnérabilité des populations touchées par les éclosions dans ces milieux. L’infection à norovirus entraîne souvent des symptômes prolongés chez les personnes âgées fragiles et à mobilité réduite [8]. les données épidémiologiques publiées, il n’a pas été possible d’évaluer si les paramètres de santé peuvent avoir été un indicateur des facteurs intrinsèques de la vulnérabilité des patients, tels que l’âge ou les comorbidités. ou visiteurs Malheureusement, seule une minorité d’études dans notre revue Si plus d’études ont rapporté des taux d’hospitalisation et de mortalité distincts pour le personnel et les patients / résidents, nous nous attendons à ce que les estimations de la fréquence de la maladie sévère dans ces populations spécifiques auraient été encore plus élevés. Les taux élevés de NoV sont les plus élevés dans les groupes d’âge plus jeunes [10], ce qui fait de l’âge avancé un facteur de risque pour les taux d’hospitalisation et de létalité associés aux NoV plus élevés car l’âge n’a pas été rapporté Cependant, comme la plupart des patients hospitalisés et des établissements de soins de longue durée sont des personnes âgées, l’établissement d’une éclosion est probablement un très fort indicateur de l’âge. d’origine hydrique, de personne à personne ou une combinaison de ces voies dans 63% des éclosions Proliférations Dans de nombreux établissements de soins de longue durée ou en milieu hospitalier, où de grands groupes d’individus vivent habituellement à proximité, on a souvent classé la transmission d’une personne à l’autre comme la transmission d’origine alimentaire et hydrique la plus fréquente dans nos données. Les études de surveillance basées sur des bases de données suggèrent que la majorité des épidémies de NoV impliquent principalement la transmission de personne à personne [1, 11, 12], suggérant un biais de publication favorisant les rapports de transmission alimentaire et hydrique. Heureusement, ce biais n’affecterait pas Nos estimations de l’association entre le mode de transmission et les résultats graves En outre, cela peut être dû aux rapports d’éclosion qui ont conclu que les éclosions survenues pendant plusieurs jours dans les milieux communautaires étaient le résultat d’une transmission alimentaire ou hydrique, même lorsqu’une source spécifique n’était pas identifiée Il est possible que la voie de transmission ait été mal classée dans certaines de ces épidémies. Des tests épidémiologiques peuvent toutefois aider à attribuer les épidémies de gastro-entérite à la maladie NoV [13]. Cependant, les tests PCR de NoV sont devenus plus répandus ces dernières années [14], et il existe désormais un immuno-essai enzymatique autorisé par la Food and Drug Administration. États-Unis Toutes les éclosions publiées évaluées dans cette étude ont utilisé des tests de laboratoire de confirmation En comparant les foyers connus pour être dus à GII4 avec ceux connus pour être dus à une souche autre que GII4, nous avons trouvé une différence frappante dans le taux de mortalité et d’hospitalisation. Ce génotype peut être responsable d’une maladie grave Des observations précédentes montrant que les souches GII sont excrétées à des niveaux plus élevés [15], sont plus susceptibles de provoquer des vomissements et de provoquer des maladies plus sévères chez les enfants [16, 17] , démontrent un modèle cohérent Les norovirus évoluent rapidement et des souches distinctes ont émergé tous les 2-4 ans au cours de la dernière décennie [18-20] Au moins 2 GII4 Les tentatives de réduction du fardeau de la maladie ont été axées sur la surveillance efficace des maladies et la limitation de la transmission des maladies. Nous avons à nouveau souligné l’importance de prévention des flambées et contrôle des flambées dans les établissements de santé, où les hospitalisations et les décès sont plus susceptibles de se produire. De plus, les vaccins NoV sont en cours de développement et il a été démontré qu’en principe, il est possible de vacciner un défi homotypique [21] Notre analyse met en évidence l’importance de développer des vaccins contre les virus GII4 qui sont sûrs et efficaces, en particulier pour les populations vulnérables qui souffrent de graves maladies, y compris la mort

Remarques

Avertissement Les constatations et les conclusions de ce rapport sont celles des auteurs et ne représentent pas nécessairement les points de vue des Centres de contrôle et de prévention des maladies CDCFancien soutien Ce travail a été soutenu par la subvention de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses 1K01AI087724-01 à JSL à les National Institutes of Health; l’Institut national de l’alimentation et de l’agriculture du Département de l’agriculture des États-Unis, numéro de subvention 2010-85212-20608; Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués